More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2874 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  63.05 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  61.89 
 
 		 646 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  58.47 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  58.06 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  58.06 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  56.28 
 
 		 650 aa  287  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  55 
 
 		 251 aa  274  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 250 aa  273  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  53.44 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 256 aa  268  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 		 250 aa  267  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  55.69 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  51.63 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  53.04 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  54.25 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  50.99 
 
 		 253 aa  248  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  47.92 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.97 
 
 		 655 aa  242  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  47.08 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50.84 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  49.79 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  51.08 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 256 aa  234  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  234  8e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  50.65 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 254 aa  228  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 		 249 aa  228  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  48.32 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  50.21 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  47.93 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49 
 
 		 654 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  45.31 
 
 		 260 aa  223  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  47.11 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 		 264 aa  222  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  46.69 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.11 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  47.9 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 253 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  46.31 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  45.8 
 
 		 248 aa  215  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  48.96 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  43.55 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  45.9 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  46.75 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>