More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2843 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 		 302 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  48 
 
 		 301 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  45.48 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  43.71 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  42.86 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  42.86 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  42.86 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  43.19 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  43.19 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  43.19 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  42.86 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  43 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  37.38 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  38.59 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  40 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  39.68 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  41.72 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  36.31 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  37.54 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  37.66 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  36.65 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  35.6 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  35.6 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  35.6 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  35.6 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  37.3 
 
 		 317 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  35.6 
 
 		 326 aa  195  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  35.51 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  37.66 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  36.42 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  37.62 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  36.45 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  38.56 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  34.6 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  35.53 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  37.9 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  38.83 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  36.57 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  36.22 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  35.24 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  35.14 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  34.84 
 
 		 390 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  32.8 
 
 		 346 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  34.5 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  31.96 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  33.01 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  32.57 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  32.13 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1572  CheY-like domain-containing protein  45.4 
 
 		 162 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.707212  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  29.38 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  30.32 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  33.11 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  30.41 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  33.67 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  34.03 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  28.52 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  28.52 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  28.86 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  31.34 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  28.98 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  30.39 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  33.56 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  29.45 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  32.51 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  27.74 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  30.04 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  32.18 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  30.58 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  30.74 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  28.47 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  30.04 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  31.33 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  31.16 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  32.2 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  28.26 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  31.21 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  30.13 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  30.33 
 
 		 311 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  30.34 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  29.37 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  31.36 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  32.17 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  30.87 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  32.17 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  28.14 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  30.21 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  28.9 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  28.53 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  28.53 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  30.56 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  33.33 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  30.29 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  29.97 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  30.29 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  29.97 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  29.21 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  31.63 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  28.66 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  31.53 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  29.81 
 
 		 324 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>