238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2839 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
225 aa  466  1e-130  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  63.11 
 
 
224 aa  303  2e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.1363e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  62.67 
 
 
229 aa  301  6e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  59.19 
 
 
225 aa  286  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  60 
 
 
229 aa  278  6e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  59.55 
 
 
225 aa  273  2e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  60 
 
 
223 aa  271  4e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  59.73 
 
 
226 aa  270  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.79843e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  59.09 
 
 
225 aa  269  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 
225 aa  264  9e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  55.36 
 
 
225 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  55.36 
 
 
225 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  56.16 
 
 
224 aa  262  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  54.91 
 
 
225 aa  261  7e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 
225 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 
225 aa  260  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  54.91 
 
 
225 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
225 aa  258  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  54.71 
 
 
225 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  54.71 
 
 
225 aa  256  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  54.79 
 
 
223 aa  256  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  53.78 
 
 
244 aa  244  5e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 
241 aa  243  1e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  53.81 
 
 
231 aa  243  1e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  53.81 
 
 
231 aa  243  1e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  50.91 
 
 
235 aa  241  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 
226 aa  241  8e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  56.74 
 
 
228 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  52.23 
 
 
261 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  56.74 
 
 
228 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
225 aa  238  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
229 aa  238  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
218 aa  238  6e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 
222 aa  238  6e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  52.27 
 
 
229 aa  238  7e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  50.91 
 
 
232 aa  237  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 
230 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
233 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  52.27 
 
 
233 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  53.46 
 
 
220 aa  236  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  51.38 
 
 
221 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  53 
 
 
225 aa  235  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  51.35 
 
 
231 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 
226 aa  235  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  54.09 
 
 
230 aa  235  5e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 
218 aa  234  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 
218 aa  234  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
223 aa  234  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  52.27 
 
 
230 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  53.81 
 
 
225 aa  233  1e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 
230 aa  233  1e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 
226 aa  234  1e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 
222 aa  233  2e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
245 aa  233  2e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  51.38 
 
 
221 aa  233  2e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 
229 aa  232  3e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 
227 aa  232  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.21221e-06  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 
231 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  53.42 
 
 
224 aa  232  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  50.9 
 
 
229 aa  231  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 
268 aa  231  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 
232 aa  231  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  53.18 
 
 
230 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 
221 aa  231  7e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 
225 aa  231  8e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  53.21 
 
 
269 aa  230  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.1966e-11  hitchhiker  5.89305e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
230 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 
222 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  54.38 
 
 
226 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 
225 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
229 aa  228  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  53.95 
 
 
229 aa  228  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
229 aa  228  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
229 aa  228  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
229 aa  228  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 
229 aa  228  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.00069e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  55.09 
 
 
228 aa  228  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  55.09 
 
 
228 aa  228  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  53.02 
 
 
228 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  51.8 
 
 
221 aa  227  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
243 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  55.09 
 
 
228 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  51.35 
 
 
221 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  51.38 
 
 
221 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
229 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  52.5 
 
 
216 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
229 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
229 aa  226  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  53.02 
 
 
229 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 
218 aa  225  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  52.56 
 
 
229 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  52.56 
 
 
229 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  49.08 
 
 
221 aa  224  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  52.56 
 
 
229 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 
240 aa  224  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  3.21985e-05  hitchhiker  1.31635e-09 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  53.02 
 
 
228 aa  224  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  52.56 
 
 
229 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  53.02 
 
 
229 aa  224  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
221 aa  224  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  51.8 
 
 
221 aa  224  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>