More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2790 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  48.39 
 
 		 217 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  48.39 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  38.94 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0682  HAD hydrolase, family IA, variant 3  33.51 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  34.6 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  32.7 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.71 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.56 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  32.61 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.55 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.13 
 
 		 238 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01320  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.44 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.57 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.8 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  35.83 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.33 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000345367  normal  0.0902559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  32.18 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.05 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.77 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.77 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  30.05 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.15 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.19 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  33.15 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.22 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.53 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  30.7 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  33.16 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  33.95 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  30.94 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  32.26 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.52 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.34 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33.16 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  35.14 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4703  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 271 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.69 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.69 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.22 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.72 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.2 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.44 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32.65 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.1 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.33 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.02 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.84 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.57 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.96 
 
 		 222 aa  91.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  27.49 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.19 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.09 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  31.52 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.88 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.38 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  29.89 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.89 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.19 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  29.44 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.87 
 
 		 456 aa  89  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.2 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.19 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1217  HAD family sugar phosphatase  30 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.03 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.19 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.45 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  30.2 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  32.45 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  30.12 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2435  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396573  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  32.45 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  32.45 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.45 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  32.45 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>