118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2776 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  181  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  59.34 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  57.83 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  54.65 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  51.19 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  56.63 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  55.17 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  53.49 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  53.49 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  52.87 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  48.86 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  44.94 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  47.62 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  45.68 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  49.32 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  48.72 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  48.72 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  41.98 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  46.75 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  46.58 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  46.58 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  46.58 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  46.58 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  46.58 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  46.58 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  46.58 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  46.58 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  45.88 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  46.58 
 
 		 90 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  47.19 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  40.74 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  35.56 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  46.58 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  45.21 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  52.17 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  43.04 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  33.72 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  38.27 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  34.09 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  42.05 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  36.23 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  42.05 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  36.05 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  39.24 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  44.93 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  33.72 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.78 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  37.31 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.22 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  35.37 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  35.14 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.47 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  32.88 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  40.62 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  32.91 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  32.95 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  36.25 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  39.44 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  29.67 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  34.57 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  35.94 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  31.82 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  32.91 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  32.18 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  35.82 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  28.41 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  33.68 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1140  hypothetical protein  35.94 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  31.25 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  37.5 
 
 		 212 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  35.44 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  30.86 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  28.92 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  32.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  32.1 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  32.1 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  28.92 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  34.41 
 
 		 246 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  31.65 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28256  predicted protein  28.4 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0473173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  34.38 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1060  hypothetical protein  35.53 
 
 		 97 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0185112  normal  0.0579872 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2127  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144756  decreased coverage  0.00998453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23460  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  28.57 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.0432341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  26.83 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf786  putative transcription termination factor  29.07 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  26.83 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.91 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  33.72 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  30.88 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  26.83 
 
 		 257 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  28.09 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  31.46 
 
 		 252 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7743  protein of unknown function DUF448  34.78 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>