More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2758 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2758  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
273 aa  537  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000523716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.73 
 
 
272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  65.31 
 
 
278 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10180  Undecaprenyl-diphosphatase  55.14 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00316113  normal  0.0119767 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.62 
 
 
284 aa  289  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0138  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.07 
 
 
279 aa  288  8e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0945  Undecaprenyl-diphosphatase  49.17 
 
 
311 aa  280  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130471  hitchhiker  0.000579984 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16350  Undecaprenyl-diphosphatase  48.68 
 
 
314 aa  278  5e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0173909 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0381  Undecaprenyl-diphosphatase  49.01 
 
 
310 aa  273  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.100133  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  48.44 
 
 
268 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.82 
 
 
284 aa  248  5e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.44 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  48.53 
 
 
270 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  49.25 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0133  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.08 
 
 
293 aa  237  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  45.17 
 
 
293 aa  237  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.16 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1147  Bacitracin resistance protein BacA  45.09 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000333302  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  41.73 
 
 
273 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.82 
 
 
283 aa  192  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.08 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0750612  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.97 
 
 
280 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.27 
 
 
304 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
273 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.64 
 
 
273 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.64 
 
 
273 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
273 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.23 
 
 
276 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.29 
 
 
266 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.27 
 
 
273 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  43.27 
 
 
273 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  43.27 
 
 
273 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.27 
 
 
273 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.27 
 
 
273 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.27 
 
 
273 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
269 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.75 
 
 
270 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.03 
 
 
280 aa  185  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
268 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  39.78 
 
 
268 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.33 
 
 
272 aa  185  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.14 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  43.08 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  42.31 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  43.08 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.25 
 
 
276 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.11 
 
 
273 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.25 
 
 
276 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.25 
 
 
276 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  41.61 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.8 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.92 
 
 
277 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  42.41 
 
 
267 aa  182  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
276 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  40.98 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.66 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  37.28 
 
 
283 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.87 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  38.24 
 
 
276 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  37.28 
 
 
283 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.6 
 
 
275 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.72 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.54 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.97 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.1 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.08 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  39.49 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.45 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  38.49 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.85 
 
 
272 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  36.56 
 
 
283 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.85 
 
 
272 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.85 
 
 
272 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.73 
 
 
293 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
272 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.33 
 
 
303 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 
268 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.89 
 
 
278 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
281 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  37.28 
 
 
269 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  37.69 
 
 
255 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
274 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 
268 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  40.29 
 
 
269 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.09 
 
 
277 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  43.31 
 
 
258 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  40.36 
 
 
269 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
272 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.08 
 
 
268 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.93 
 
 
268 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.7 
 
 
274 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.72 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.78 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  38.24 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>