71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2718 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2718  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 
106 aa  215  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.78 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.64 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.64 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.64 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.54 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.56 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.63 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  43.84 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  35.11 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
100 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.14 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.94 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  41.82 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.56 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.33 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  34.41 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.57 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.76 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.1 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32 
 
 
110 aa  47  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 
120 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  39.19 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.41 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.48 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.78 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  36.49 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.48 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  32.88 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.25 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  31.86 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  34.25 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.87 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  30.39 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  35.16 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.63 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  34.25 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  32.63 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.25 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  34.25 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
111 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  28.4 
 
 
114 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.27 
 
 
96 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
111 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.84 
 
 
110 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.3 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0495039  hitchhiker  0.00146137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0052  flagellar protein FliE  28.3 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  29.07 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.88 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.88 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.5 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 
110 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.67 
 
 
102 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  31.03 
 
 
104 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 
110 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  36.99 
 
 
110 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>