More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2696 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2696  flagellar biosynthetic protein FlhB  100 
 
 
373 aa  748    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.2 
 
 
392 aa  289  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.62 
 
 
360 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  40.43 
 
 
369 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1163  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 
351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2032  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.01 
 
 
381 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.112007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1316  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.8 
 
 
366 aa  265  7e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  42.39 
 
 
366 aa  263  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.78 
 
 
356 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.29 
 
 
363 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.46 
 
 
350 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  41.48 
 
 
355 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.54 
 
 
374 aa  259  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.54 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.11 
 
 
361 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.14 
 
 
354 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.97 
 
 
357 aa  254  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3804  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.26 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0130  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.68 
 
 
406 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561684  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2021  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.78 
 
 
360 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0999  flagellar biosynthesis protein FlhB  42.7 
 
 
357 aa  248  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.83 
 
 
390 aa  245  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3034  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.89 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1552  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.61 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00640595  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.64 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4196  flagellar biosynthesis protein FlhB  40.11 
 
 
354 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.31 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.92 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1975  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.84 
 
 
378 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0713  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.2 
 
 
379 aa  242  9e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.31011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3441  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.4 
 
 
378 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.35 
 
 
362 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2809  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.61 
 
 
378 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326255  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.35 
 
 
362 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1515  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.92 
 
 
376 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.813027  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.03 
 
 
358 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3821  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.4 
 
 
353 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1981  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.6 
 
 
378 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02874  flagellar biosynthesis protein  38.33 
 
 
374 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3878  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 
378 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002828  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.46 
 
 
376 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0240  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.51 
 
 
353 aa  236  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3287  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.66 
 
 
357 aa  235  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.02 
 
 
354 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45720  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.44 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.79 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3094  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.89 
 
 
353 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  39.15 
 
 
384 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.52 
 
 
358 aa  232  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0426  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.47 
 
 
352 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.7 
 
 
398 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03148  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.74 
 
 
376 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0960  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.67 
 
 
384 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1547  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.87 
 
 
383 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0849  flagellar biosynthetic protein FlhB  40.27 
 
 
377 aa  229  7e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4352  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.28 
 
 
380 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.546846  normal  0.108757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1245  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.36 
 
 
390 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215857  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1702  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.87 
 
 
376 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2840  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 
399 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.57 
 
 
399 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3914  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.66 
 
 
380 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2016  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.43 
 
 
387 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.42 
 
 
399 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.96 
 
 
380 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2129  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.64 
 
 
383 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000192021 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1331  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.64 
 
 
383 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  hitchhiker  0.0000000000516194 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2169  flagellar biosynthesis protein FlhB  39.44 
 
 
376 aa  226  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1208  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.87 
 
 
383 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2074  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.87 
 
 
383 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2069  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.87 
 
 
383 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.75 
 
 
353 aa  224  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  38.59 
 
 
363 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  37.36 
 
 
374 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3678  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.44 
 
 
380 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.10386  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.74 
 
 
377 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3698  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.21 
 
 
380 aa  222  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0239481 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2295  flagellar biosynthesis protein FlhB  35 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.79 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.26 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2447  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.52 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.83 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1944  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.1 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0481  flagellar biosynthetic protein FlhB  36.54 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  34.52 
 
 
382 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.26 
 
 
363 aa  219  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  35.63 
 
 
350 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3905  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.25 
 
 
353 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447126 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.9 
 
 
377 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04964  flagellar biosynthesis pathway, component FlhB  35.75 
 
 
375 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0181  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.36 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1862  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.85 
 
 
383 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2604  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.5 
 
 
383 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0194  flagellar biosynthesis protein FlhB  36.36 
 
 
399 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  38.87 
 
 
405 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2432  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.71 
 
 
386 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5492  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.69 
 
 
359 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0379  flagellar biosynthesis protein FlhB  35.01 
 
 
357 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0669  flagellar biosynthesis protein FlhB  37.54 
 
 
350 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0757109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1866  flagellar biosynthesis protein FlhB  33.61 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.965675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>