More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2595 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  100 
 
 
176 aa  361  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 
180 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  45.29 
 
 
179 aa  148  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  47.68 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 
179 aa  144  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
182 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
186 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  43.35 
 
 
186 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
180 aa  137  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  44.23 
 
 
179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
178 aa  134  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  39.87 
 
 
176 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 
184 aa  131  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
179 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  43.59 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  43.59 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  43.59 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  43.59 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  43.59 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  43.59 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  36.53 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  42.95 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  39.24 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  40.48 
 
 
187 aa  129  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  42.95 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0604  MutT/nudix family protein  47.67 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  38.22 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
281 aa  124  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 
177 aa  123  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
177 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 
178 aa  123  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
179 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
171 aa  122  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
177 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  39.29 
 
 
183 aa  120  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 
192 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  40.13 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
199 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  37.58 
 
 
171 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 
184 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
195 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
183 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  35.93 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  38.22 
 
 
171 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  33.96 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
208 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  41.82 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
201 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
190 aa  111  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  35.26 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  43.57 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
201 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
180 aa  108  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 
180 aa  108  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
200 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
184 aa  106  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  33.33 
 
 
194 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
194 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
179 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
184 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
169 aa  105  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
210 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  33.12 
 
 
185 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1537  MutT/nudix family protein  42.86 
 
 
184 aa  105  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.29 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  35.29 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 
201 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.29 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  35.29 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.29 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.29 
 
 
196 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.29 
 
 
196 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.29 
 
 
196 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
196 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
189 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
172 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
176 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
166 aa  102  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 
196 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 
196 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
196 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  36 
 
 
182 aa  101  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>