229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2591 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  100 
 
 
441 aa  890    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  61.86 
 
 
433 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.46 
 
 
434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.46 
 
 
434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.46 
 
 
434 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.23 
 
 
434 aa  512  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.23 
 
 
434 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.23 
 
 
434 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.23 
 
 
434 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.23 
 
 
434 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.23 
 
 
434 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.23 
 
 
434 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  60.23 
 
 
434 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1977  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.68 
 
 
433 aa  509  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2004  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.68 
 
 
433 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1756  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.68 
 
 
433 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.212389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1705  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.68 
 
 
433 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3449  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.68 
 
 
433 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0452293  hitchhiker  9.91695e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1894  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.68 
 
 
433 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000430221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2062  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  61.66 
 
 
433 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1776  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  61.43 
 
 
433 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1929  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.68 
 
 
433 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03249e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1734  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.68 
 
 
433 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000258964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1897  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.49 
 
 
431 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000548599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1754  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.45 
 
 
433 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  59.3 
 
 
439 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.6 
 
 
438 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  57.11 
 
 
431 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  56.09 
 
 
433 aa  471  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  58 
 
 
440 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2210  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.4 
 
 
433 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2172  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.4 
 
 
433 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  53.9 
 
 
444 aa  461  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  56.81 
 
 
434 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.46 
 
 
434 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.69 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1101  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.09 
 
 
438 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.61 
 
 
434 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  54.38 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.92 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  51.96 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  53.23 
 
 
433 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  52.98 
 
 
435 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.47 
 
 
441 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.21 
 
 
582 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.93 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.94 
 
 
434 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0039  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.71 
 
 
433 aa  422  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0183104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.35 
 
 
430 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.88 
 
 
434 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.96 
 
 
435 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  49.08 
 
 
433 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.96 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1531  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.88 
 
 
430 aa  388  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.291461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.96 
 
 
437 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1280  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  48.84 
 
 
441 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.6 
 
 
435 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1789  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.19 
 
 
435 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.06 
 
 
446 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0508  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.88 
 
 
434 aa  363  3e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.27 
 
 
435 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.02 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  47.03 
 
 
435 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  46.78 
 
 
434 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  47.87 
 
 
435 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.82 
 
 
432 aa  345  7e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl119  thymidine phosphorylase  44.42 
 
 
434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0757  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  45.48 
 
 
437 aa  341  1e-92  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.96 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
425 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.86 
 
 
431 aa  339  5e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.71 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  43.54 
 
 
426 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002630  thymidine phosphorylase  44.06 
 
 
442 aa  334  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  43.54 
 
 
440 aa  332  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  41.83 
 
 
426 aa  332  9e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  41.93 
 
 
426 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.41 
 
 
431 aa  330  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  42.82 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1021  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.11 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.171044  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  43.34 
 
 
443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03376  thymidine phosphorylase  43.38 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.69 
 
 
431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  44.33 
 
 
424 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2814  thymidine phosphorylase  44.14 
 
 
443 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000364581  unclonable  0.00000355939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  42.52 
 
 
424 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.33 
 
 
431 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1928  thymidine phosphorylase  42.92 
 
 
475 aa  323  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.939437  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1591  thymidine phosphorylase  41.53 
 
 
438 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6240  thymidine phosphorylase  41.53 
 
 
438 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683278  normal  0.643776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  43.58 
 
 
427 aa  323  5e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0661  thymidine phosphorylase  43.46 
 
 
440 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  41.69 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1142  thymidine phosphorylase  42.32 
 
 
440 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.698076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3451  thymidine phosphorylase  42.35 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  43.4 
 
 
429 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3548  thymidine phosphorylase  41.3 
 
 
443 aa  319  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0580318  hitchhiker  0.0000567233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  42.22 
 
 
433 aa  319  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  42.21 
 
 
433 aa  319  7e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.51 
 
 
429 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.615956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>