More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2548 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
429 aa  859    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  55.24 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.01 
 
 
425 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  52.17 
 
 
427 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  52.89 
 
 
428 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  52.89 
 
 
428 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  49.42 
 
 
423 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  49.66 
 
 
428 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.3 
 
 
426 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  48.38 
 
 
432 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  46.42 
 
 
430 aa  355  7.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  46.42 
 
 
430 aa  355  7.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  48.37 
 
 
422 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.45 
 
 
426 aa  352  7e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  45.5 
 
 
430 aa  346  4e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  45.56 
 
 
439 aa  346  4e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.8 
 
 
452 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  46.45 
 
 
437 aa  343  4e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  46.42 
 
 
428 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  45.01 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  47.21 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  46.9 
 
 
419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  47.33 
 
 
427 aa  335  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  46.19 
 
 
428 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  45.96 
 
 
428 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  45.96 
 
 
428 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  45.96 
 
 
428 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  46.47 
 
 
428 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  46.08 
 
 
428 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  45.96 
 
 
428 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  45.96 
 
 
428 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.37 
 
 
425 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  45.56 
 
 
435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.22 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.65 
 
 
437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  47.78 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  43.49 
 
 
435 aa  325  7e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  45.67 
 
 
423 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  43.15 
 
 
439 aa  323  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  43.26 
 
 
435 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.29 
 
 
428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  45.54 
 
 
428 aa  318  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.7 
 
 
426 aa  315  9e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.52 
 
 
417 aa  313  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.54 
 
 
338 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.33 
 
 
482 aa  308  9e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.42 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  43.96 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.65 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.46 
 
 
415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.23 
 
 
338 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  42.83 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.84 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.48 
 
 
346 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.04 
 
 
333 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  46.37 
 
 
425 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  49.7 
 
 
353 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  51.54 
 
 
338 aa  300  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  45.45 
 
 
439 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.8 
 
 
435 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.4 
 
 
387 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.23 
 
 
338 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50 
 
 
354 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50 
 
 
354 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  44.04 
 
 
436 aa  297  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.8 
 
 
454 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50 
 
 
354 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.85 
 
 
338 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  43.78 
 
 
424 aa  294  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  46.21 
 
 
424 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  52.01 
 
 
337 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  47.43 
 
 
338 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.97 
 
 
434 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.44 
 
 
464 aa  293  4e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  43.12 
 
 
457 aa  293  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  43.99 
 
 
424 aa  292  7e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  38.37 
 
 
500 aa  292  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.04 
 
 
338 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  49.1 
 
 
341 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  49.1 
 
 
341 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.52 
 
 
439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  49.23 
 
 
337 aa  289  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  47.32 
 
 
358 aa  289  8e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.53 
 
 
427 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  49.7 
 
 
370 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.08 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.35 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  47.9 
 
 
356 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  49.4 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  48.8 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  47.59 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  49.39 
 
 
373 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.53 
 
 
491 aa  282  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  47.45 
 
 
365 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  48.19 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  47.71 
 
 
397 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  48.19 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  48.19 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  48.19 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  48.19 
 
 
372 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>