More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2537 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  47.61 
 
 		 679 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  51.01 
 
 		 695 aa  723    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  100 
 
 		 697 aa  1425    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  46.41 
 
 		 696 aa  654    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  46.7 
 
 		 696 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  48.48 
 
 		 694 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  50.07 
 
 		 694 aa  710    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  47.67 
 
 		 682 aa  626  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  43.69 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  44.48 
 
 		 670 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  44.67 
 
 		 682 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  41.55 
 
 		 696 aa  591  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  42.65 
 
 		 673 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  44.3 
 
 		 680 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  42.73 
 
 		 683 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  42.69 
 
 		 694 aa  581  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  42.39 
 
 		 686 aa  570  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  42.96 
 
 		 683 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  43.33 
 
 		 673 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  43.19 
 
 		 667 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  41.64 
 
 		 695 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  42.55 
 
 		 692 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  41.81 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  39.91 
 
 		 701 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  40.72 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  40.57 
 
 		 697 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  40.29 
 
 		 692 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  42.45 
 
 		 696 aa  551  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  42.05 
 
 		 701 aa  549  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  40.9 
 
 		 697 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  40.32 
 
 		 697 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  40.96 
 
 		 691 aa  547  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  40.85 
 
 		 692 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  39.63 
 
 		 701 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  40.32 
 
 		 691 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  41.69 
 
 		 692 aa  541  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  41.25 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  41.17 
 
 		 689 aa  535  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  39.11 
 
 		 697 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  39.11 
 
 		 697 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  39.11 
 
 		 697 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  40.14 
 
 		 697 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  39.68 
 
 		 692 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  40.38 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  40.55 
 
 		 691 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  39.94 
 
 		 689 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  40.55 
 
 		 691 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  39.85 
 
 		 697 aa  525  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.43 
 
 		 701 aa  525  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  38.43 
 
 		 701 aa  522  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  38.95 
 
 		 692 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  40.2 
 
 		 693 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  39.44 
 
 		 692 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  40.09 
 
 		 691 aa  520  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.88 
 
 		 697 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  38.78 
 
 		 692 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  39.39 
 
 		 692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  38.62 
 
 		 692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  39.97 
 
 		 692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  39.14 
 
 		 691 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  40.12 
 
 		 690 aa  517  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  39.97 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  38.74 
 
 		 691 aa  512  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  39.07 
 
 		 697 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  38.98 
 
 		 689 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  39.34 
 
 		 698 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  38.74 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  38.86 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  38.65 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  38.92 
 
 		 692 aa  510  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  40.23 
 
 		 689 aa  512  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  38.23 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  38.06 
 
 		 699 aa  509  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  40.23 
 
 		 701 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  38.74 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  38.52 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.03 
 
 		 691 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  38.52 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  40.17 
 
 		 698 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  38.52 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  38.52 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  38.52 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  39.51 
 
 		 688 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  38.52 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  39.65 
 
 		 694 aa  509  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  39.51 
 
 		 694 aa  508  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  39.54 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  40.46 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  37.77 
 
 		 693 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  38.01 
 
 		 699 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  38.52 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  41.65 
 
 		 691 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  38.49 
 
 		 694 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  41.04 
 
 		 688 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  38.38 
 
 		 691 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  38.37 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  38.28 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  38.43 
 
 		 693 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  38.62 
 
 		 698 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  38.23 
 
 		 692 aa  505  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>