More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2536 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  37.18 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  37.93 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  37.02 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  38.63 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  37.13 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  37.5 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  35.8 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  37.61 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  35.34 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.24 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  34.3 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  35.68 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  39.3 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  37.67 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  32.41 
 
 		 253 aa  151  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  38.03 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  35.5 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  35.02 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  34.31 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  37.55 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  36.52 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  36.52 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  36.05 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  36.09 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  31.78 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  36.44 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  36.32 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  35.32 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  30.6 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  33.9 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  33.9 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  33.9 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  34.48 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  29.88 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  34.1 
 
 		 273 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  37.56 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  34.07 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  34.2 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  35.86 
 
 		 602 aa  135  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  39.44 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  35.02 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  36.45 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  34.02 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  35.81 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  33.33 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  34.02 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  30.33 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  34.74 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  34.57 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2327  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.13 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  32.35 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1508  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.13 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1824  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.13 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1940  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.13 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.343934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01275  gamma-Glu-GABA hydrolase  33.73 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01286  hypothetical protein  33.73 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  34.21 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2348  peptidase C26  33.73 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  30.64 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1413  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  33.73 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  34.12 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  30.53 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1740  peptidase C26  35.14 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000655544 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  27.16 
 
 		 275 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  31.8 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2067  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  31.33 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  31.45 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  35.35 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  33.8 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  29.6 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  31.67 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  31.08 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  32.89 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  32.59 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  34.12 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  32 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  32 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  35.38 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  32.29 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  33.02 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  29.15 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  32.51 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  33.18 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  28.68 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  29.6 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2902  glutamine amidotransferase, putative  32.94 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00530511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  33.04 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  31.82 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2669  peptidase C26  29.84 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0275908  normal  0.209518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  29.15 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  28.4 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  29.2 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  35.98 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  33.49 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2865  peptidase C26  33.94 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136742  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5298  peptidase C26  32.39 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.49084 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  29.72 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  28.93 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  38.04 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>