More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2512 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 335 aa  678    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  43.23 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  43.23 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  40.8 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  38.3 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  41.32 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  37.99 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  42.14 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  41.81 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  46.24 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  38.84 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  38.48 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  39.09 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  35.76 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  41.39 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  39.67 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  36.81 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  37.2 
 
 		 297 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  40.94 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  36.89 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.6 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  41.61 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  39.2 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  40.33 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  35.8 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  36.79 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  35.62 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  36.42 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  37.12 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  40.27 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 300 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  36.62 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  37.27 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  37.74 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  36.83 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  36 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  37.46 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  37.43 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  40.47 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  36.89 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  38.16 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  37.78 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  35.5 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  35.92 
 
 		 296 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  37.82 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  36.36 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  38.32 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  38.32 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  38.94 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  34.42 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  41.22 
 
 		 296 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  33.23 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  38.01 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  38.01 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  38.01 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  38.01 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  38.01 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  37.69 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  34.82 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  35.05 
 
 		 298 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  35 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  37.58 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  34.81 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 290 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  36.62 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.13 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  36.36 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  32.23 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  38.1 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  34.52 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  35.03 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  35.37 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  34.24 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  37.54 
 
 		 296 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 		 314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  39.47 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  35.15 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 294 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  35.28 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1935  farnesyl-diphosphate synthase  33.11 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  34.34 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  33.9 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  38 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  35.37 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  38 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  35.37 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>