More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2509 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 
285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  40.56 
 
 
288 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  43.06 
 
 
286 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  39.79 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  40 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  37.85 
 
 
286 aa  208  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  37.89 
 
 
302 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  36.68 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  37.07 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  39.02 
 
 
284 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  35.76 
 
 
285 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06550  ATP-NAD/AcoX kinase  39.91 
 
 
260 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000264989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1046  NAD(+) kinase  36.46 
 
 
285 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  35.54 
 
 
311 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  42.67 
 
 
283 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2071  NAD(+)/NADH kinase  36.49 
 
 
276 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.323141  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1785  NAD(+)/NADH kinase  36.49 
 
 
276 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.422764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  36.7 
 
 
290 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  36.16 
 
 
303 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  34.03 
 
 
288 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0915  NAD(+) kinase  34.28 
 
 
299 aa  185  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.895385  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1770  ATP-NAD/AcoX kinase  33.91 
 
 
282 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  34.86 
 
 
287 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  34.56 
 
 
309 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  33.96 
 
 
290 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  40.09 
 
 
285 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1085  NAD(+) kinase  39.3 
 
 
284 aa  176  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  37.08 
 
 
278 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3486  ATP-NAD/AcoX kinase  35.09 
 
 
268 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00826859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2618  NAD(+) kinase  34.88 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0731  NAD(+) kinase  35.77 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1029  NAD(+) kinase  36.11 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.501907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1396  NAD(+) kinase  33.1 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  39.37 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  35.77 
 
 
282 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  35.38 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.93 
 
 
292 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.16 
 
 
293 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  34.04 
 
 
303 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2773  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.21 
 
 
292 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000370492  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33 
 
 
297 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986122  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1108  ATP-NAD/AcoX kinase  36.91 
 
 
280 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.64 
 
 
309 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000702127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.14 
 
 
294 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2072  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.32 
 
 
294 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  35.96 
 
 
301 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.94 
 
 
292 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  32.86 
 
 
285 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1391  ATP-NAD/AcoX kinase  37.23 
 
 
257 aa  169  4e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.209895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  34.07 
 
 
302 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3331  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
307 aa  169  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000815034  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2165  ATP-NAD/AcoX kinase  34.39 
 
 
285 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.29 
 
 
309 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.18 
 
 
292 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.29 
 
 
309 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0900  ATP-NAD/AcoX kinase  33.57 
 
 
294 aa  169  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000200756  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  35.09 
 
 
301 aa  168  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.18 
 
 
309 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.94 
 
 
309 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000296073  normal  0.942574 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14301  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  38.03 
 
 
302 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0019  putative NAD+ kinase  34.97 
 
 
286 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2163  ATP-NAD/AcoX kinase  32.06 
 
 
293 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0199773 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  37.99 
 
 
290 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2792  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.6 
 
 
309 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000237572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0718  NAD(+) kinase  35.92 
 
 
283 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  32.71 
 
 
292 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1363  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.34 
 
 
302 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2573  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.53 
 
 
309 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000341976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0969  sugar kinase  31.58 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.43035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2806  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.94 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126891  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2903  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.94 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000229952  normal  0.0349698 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14681  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.93 
 
 
302 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3217  NAD(+) kinase  33.22 
 
 
292 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  34.39 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1474  ATP-NAD/AcoX kinase  32.87 
 
 
316 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0152163  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2304  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
305 aa  165  9e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.509597 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0835  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.01 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0427  ATP-NAD/AcoX kinase  30.14 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  36.4 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3297  ATP-NAD/AcoX kinase  32.86 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0523073  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16881  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.01 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2808  ATP-NAD/AcoX kinase  33.45 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14541  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.51 
 
 
302 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01131  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.61 
 
 
294 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5420  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.97 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0657  NAD(+) kinase  34.82 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3480  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.6 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0011597  normal  0.0787505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004294  NAD kinase  30.27 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.59 
 
 
312 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0499  NAD(+) kinase  33.83 
 
 
279 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0379  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.65 
 
 
294 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.520886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2015  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.71 
 
 
305 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1333  ATP-NAD/AcoX kinase  35.02 
 
 
261 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2438  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.87 
 
 
292 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.92 
 
 
315 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1591  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase, putative  32.87 
 
 
284 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306581  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02268  NAD kinase  33.7 
 
 
291 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13131  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.32 
 
 
302 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.611146  normal  0.284729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.73 
 
 
318 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.92 
 
 
296 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>