More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2487 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.27 
 
 
247 aa  194  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  44.12 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  42.44 
 
 
241 aa  184  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  40.83 
 
 
253 aa  178  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  42.98 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  40.76 
 
 
452 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  39.32 
 
 
395 aa  169  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  40.73 
 
 
258 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  40.51 
 
 
239 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  40.59 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  41.13 
 
 
250 aa  162  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  38.37 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
313 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  39.11 
 
 
250 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  39.04 
 
 
256 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  39.66 
 
 
239 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  39.08 
 
 
425 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38 
 
 
247 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  38.71 
 
 
250 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  38.71 
 
 
250 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  38.71 
 
 
250 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  38.71 
 
 
250 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  38.71 
 
 
250 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  38.71 
 
 
250 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  38.31 
 
 
250 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  38.31 
 
 
250 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  38.71 
 
 
250 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  38.11 
 
 
236 aa  158  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  38.1 
 
 
417 aa  155  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.78 
 
 
237 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  39.83 
 
 
256 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  36.69 
 
 
250 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  37.15 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  36.55 
 
 
236 aa  151  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  37.1 
 
 
274 aa  151  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  38.72 
 
 
416 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.43 
 
 
238 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 
394 aa  150  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  39.58 
 
 
261 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  38.43 
 
 
245 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  35.86 
 
 
538 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  40.93 
 
 
449 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.08 
 
 
470 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  38.75 
 
 
259 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  38.36 
 
 
421 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  38.52 
 
 
245 aa  148  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  39.33 
 
 
415 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  36.43 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  35.25 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  38.11 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  36.97 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  36.97 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  35.1 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  35.44 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  35.71 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  38.96 
 
 
296 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 
241 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  36.78 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  38.63 
 
 
319 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  36.71 
 
 
320 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  38.46 
 
 
252 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  37.29 
 
 
507 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 
240 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  36.32 
 
 
500 aa  142  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  38.15 
 
 
257 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  34.87 
 
 
389 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 
443 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 
540 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.33 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 
244 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 
419 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  37.02 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 
597 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  33.88 
 
 
554 aa  139  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2391  protein serine/threonine phosphatase  38.04 
 
 
422 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  37.39 
 
 
381 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.4 
 
 
280 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  37.8 
 
 
280 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
268 aa  138  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.19 
 
 
419 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 
472 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  35.15 
 
 
264 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 
280 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  35.34 
 
 
293 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  36.61 
 
 
264 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  35.44 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  36.63 
 
 
323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.64 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.17 
 
 
611 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  34.32 
 
 
477 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  37.87 
 
 
256 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2163  protein serine/threonine phosphatase  36.14 
 
 
337 aa  134  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1464  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.74 
 
 
322 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.88 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  35.74 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>