More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2469 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  69.83 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  70.09 
 
 		 241 aa  314  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  69.13 
 
 		 240 aa  312  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  73.49 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  68.75 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  66.1 
 
 		 239 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  65.4 
 
 		 243 aa  304  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  69.2 
 
 		 239 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  65.96 
 
 		 239 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  72.56 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  72.3 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  72.3 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  65.68 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  69.59 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  67.29 
 
 		 249 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  64.68 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  66.06 
 
 		 249 aa  291  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  67.59 
 
 		 241 aa  291  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  68.52 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  64.49 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  60.43 
 
 		 245 aa  279  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50.49 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  49.77 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  48.61 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  49.06 
 
 		 231 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  47.85 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  47.32 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  49.74 
 
 		 226 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  46.83 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  48.8 
 
 		 245 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  47.71 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  49.06 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  47.71 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 		 265 aa  181  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  47.39 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  46.89 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  44.66 
 
 		 244 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  43.19 
 
 		 232 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  43.44 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  46.15 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  56.2 
 
 		 149 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  56.57 
 
 		 118 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  54.64 
 
 		 114 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  31.76 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  30.89 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  33.33 
 
 		 257 aa  98.6  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  32.16 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  31.65 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  48.39 
 
 		 126 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  44.35 
 
 		 118 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  31.74 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  33.61 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  31.44 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  31.47 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  33.33 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  30.08 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  30.71 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  30.31 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  29.53 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3948  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000196829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3754  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000419985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 292 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3645  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74076e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3917  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000372162 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4042  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000307551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  30.2 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1744  sporulation sigma factor SigF  29.61 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  32.45 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  33.04 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  28.96 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  28.9 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4142  sporulation sigma factor SigF  29.24 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000821538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4205  sporulation sigma factor SigF  29.24 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3983  sporulation sigma factor SigF  29.24 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00304797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3829  sporulation sigma factor SigF  29.24 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000549151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  32.89 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4294  sporulation sigma factor SigF  29.24 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.728684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4094  sporulation sigma factor SigF  29.24 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5514999999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1056  sporulation sigma factor SigF  29.24 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.656155  normal  0.0661655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4182  sporulation sigma factor SigF  29.24 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0460854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>