More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2441 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  100 
 
 
406 aa  823  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.48333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  55.08 
 
 
401 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  54.9 
 
 
395 aa  416  1e-115  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  48.88 
 
 
402 aa  399  1e-110  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  48.88 
 
 
402 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  7.1198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  46.98 
 
 
403 aa  368  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.21864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  45.52 
 
 
402 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.2395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  43.25 
 
 
403 aa  339  6e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  44.97 
 
 
403 aa  338  1e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  43.53 
 
 
405 aa  336  4e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  43.72 
 
 
403 aa  336  4e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  43.72 
 
 
403 aa  336  6e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  44.75 
 
 
421 aa  335  1e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  43.72 
 
 
403 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  43.83 
 
 
402 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  43.07 
 
 
403 aa  327  2e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  42.71 
 
 
400 aa  321  1e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  40.85 
 
 
403 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  40.99 
 
 
404 aa  309  6e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  40.55 
 
 
403 aa  308  1e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  41 
 
 
403 aa  306  5e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  40.6 
 
 
403 aa  305  1e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  44.47 
 
 
537 aa  304  2e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  41.41 
 
 
408 aa  303  4e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  40.6 
 
 
403 aa  302  7e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  42.14 
 
 
402 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  40.51 
 
 
403 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  41.21 
 
 
403 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  42.82 
 
 
403 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.12424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  41.75 
 
 
401 aa  299  5e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  41.75 
 
 
401 aa  299  5e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  40.1 
 
 
402 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  40.49 
 
 
403 aa  293  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  42.46 
 
 
403 aa  291  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  41.94 
 
 
402 aa  289  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.60563e-06 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  40.98 
 
 
418 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  37.5 
 
 
415 aa  284  2e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  44.74 
 
 
404 aa  284  2e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.39723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  42.47 
 
 
412 aa  282  8e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  39.9 
 
 
402 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  39.9 
 
 
402 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  39.9 
 
 
402 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  40.4 
 
 
413 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  40.81 
 
 
406 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  40.66 
 
 
406 aa  279  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  39.04 
 
 
410 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  41.06 
 
 
402 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  41.4 
 
 
402 aa  277  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  37.44 
 
 
410 aa  277  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  41.48 
 
 
412 aa  276  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  39.01 
 
 
403 aa  274  2e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  36.34 
 
 
400 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  40.45 
 
 
402 aa  272  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  41.18 
 
 
504 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  37.72 
 
 
399 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  41.18 
 
 
504 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  40.3 
 
 
403 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.86 
 
 
332 aa  269  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  37.34 
 
 
400 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  39.18 
 
 
511 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  39.06 
 
 
408 aa  267  3e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  38.68 
 
 
404 aa  266  3e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.35 
 
 
402 aa  266  4e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  36.32 
 
 
403 aa  266  6e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  39.39 
 
 
407 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  37.16 
 
 
401 aa  265  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  37.56 
 
 
507 aa  263  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  39.75 
 
 
443 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  37.63 
 
 
401 aa  263  5e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  40.23 
 
 
520 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  38.99 
 
 
403 aa  261  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  42.94 
 
 
504 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.58 
 
 
506 aa  259  5e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.58 
 
 
506 aa  259  5e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  36.95 
 
 
412 aa  259  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  37.79 
 
 
412 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  39.04 
 
 
400 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  40.78 
 
 
414 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  38.44 
 
 
411 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  38.73 
 
 
404 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  2.83159e-06 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  41.26 
 
 
503 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  38.06 
 
 
415 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  39.74 
 
 
415 aa  255  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.63 
 
 
514 aa  255  1e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  38.29 
 
 
402 aa  254  2e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  38.15 
 
 
402 aa  254  2e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  38.82 
 
 
515 aa  254  2e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  38.3 
 
 
422 aa  253  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  38.82 
 
 
515 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  35.06 
 
 
409 aa  252  9e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  41.19 
 
 
415 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  37 
 
 
399 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  37 
 
 
399 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  38.46 
 
 
530 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  36.79 
 
 
514 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  38.36 
 
 
403 aa  249  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  39.68 
 
 
403 aa  249  8e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  38.08 
 
 
416 aa  248  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  38.46 
 
 
519 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  35.71 
 
 
411 aa  246  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>