62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2438 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  27.98 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  25.83 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  34.18 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  34.18 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  25.76 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  32.41 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  25.62 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  25.7 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.38 
 
 		 152 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  22.94 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  25.97 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  26.45 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  28.28 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.44 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  23.23 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  29.87 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 150 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  28.97 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  28.74 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  34.83 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  25.74 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  24.39 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  27.63 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  27.82 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  24.73 
 
 		 267 aa  45.1  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  28.07 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  28.07 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  28.07 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  28.07 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  27.33 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  25.13 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  23.18 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  26.85 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  24.87 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  25.71 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.64 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  24.66 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  27.81 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  27.33 
 
 		 166 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  33.71 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  26.97 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  25.18 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  27.33 
 
 		 166 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  27.21 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  26.71 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1166  regulatory protein RecX  25.89 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  24.49 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  24.34 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  25.16 
 
 		 207 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  25.81 
 
 		 153 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  28.19 
 
 		 271 aa  42  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  25.84 
 
 		 272 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  25.84 
 
 		 272 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  22.52 
 
 		 163 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  26.71 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  29.17 
 
 		 258 aa  41.6  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>