67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2428 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  100 
 
 
466 aa  957    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  34.43 
 
 
578 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  34.02 
 
 
578 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  34.02 
 
 
578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  34.02 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  34.02 
 
 
578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  34.02 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  33.61 
 
 
576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  33.61 
 
 
577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  33.61 
 
 
577 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  34.02 
 
 
578 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  28.79 
 
 
586 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2092  putative protease  34.33 
 
 
386 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  35.12 
 
 
386 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1807  murein endopeptidase  33.33 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2073  protease, putative  33.48 
 
 
386 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000121211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3332  putative protease  32.07 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000192317  unclonable  3.65908e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1852  protease  40.25 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000203248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1995  protease  40.25 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000762612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2028  putative protease  33.05 
 
 
386 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1823  murein endopeptidase  32.49 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.57805e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  36.57 
 
 
629 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1997  putative protease  31.65 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000694194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1858  transglutaminase domain-containing protein  31.36 
 
 
386 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000428903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1856  transglutaminase domain-containing protein  39.38 
 
 
363 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0548672  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  40.3 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  33.17 
 
 
390 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  37.41 
 
 
1710 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03940  Transglutaminase-like superfamily protein  27.6 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.474674  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0843  putative lipoprotein  30.19 
 
 
744 aa  75.9  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.277994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  33.54 
 
 
1821 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  30.09 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0607  putative lipoprotein  30.16 
 
 
818 aa  67  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.256534  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0514  putative lipoprotein  29.2 
 
 
756 aa  66.6  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.492219  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22380  hypothetical protein  25.25 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  36.97 
 
 
730 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1491  hypothetical protein  31.54 
 
 
530 aa  63.5  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00542195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  35.5 
 
 
4630 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22960  Transglutaminase-like superfamily protein  38.33 
 
 
424 aa  60.1  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  31.67 
 
 
1300 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0758  putative lipoprotein  28.33 
 
 
718 aa  58.2  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3064  hypothetical protein  30.63 
 
 
218 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  28.24 
 
 
1009 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  34.19 
 
 
867 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  25.44 
 
 
1279 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2123  transglutaminase domain-containing protein  30.17 
 
 
773 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.034622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.79 
 
 
752 aa  53.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  37.5 
 
 
331 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  34.03 
 
 
2042 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  30.07 
 
 
981 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0513  putative lipoprotein  36.51 
 
 
747 aa  50.4  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114455  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  32.87 
 
 
1048 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  27.52 
 
 
1361 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  38.1 
 
 
600 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02467  conserved hypothetical protein  26.27 
 
 
696 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  29.94 
 
 
1421 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2588  hypothetical protein  25.99 
 
 
195 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  26.54 
 
 
220 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  25.3 
 
 
892 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  27.74 
 
 
472 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  27.01 
 
 
472 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  41.67 
 
 
1732 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  39.22 
 
 
262 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.29 
 
 
1776 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  31.62 
 
 
316 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  43.75 
 
 
2392 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  34.31 
 
 
1732 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>