More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2404 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  100 
 
 		 440 aa  860    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  38.9 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  38.36 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  37.62 
 
 		 437 aa  278  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 451 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  32.95 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 452 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 451 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  32.72 
 
 		 451 aa  256  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 451 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  32.63 
 
 		 451 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  32.72 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  32.49 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.33 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 445 aa  227  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.75 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  33.73 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  31.41 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.16 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  31.95 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  29.55 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.44 
 
 		 459 aa  192  7e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 448 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 455 aa  186  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  30.59 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  30.66 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 442 aa  176  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  27.92 
 
 		 448 aa  177  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.17 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 461 aa  171  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.75 
 
 		 467 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.81 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 451 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  27.19 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 454 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.96 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.09 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  29.27 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  29.86 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  27.07 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 456 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  28.54 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  26.24 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 447 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  26.68 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.38 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.38 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  33.06 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25.79 
 
 		 496 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 458 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.95 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.51 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  26.71 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  26.71 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 466 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.31 
 
 		 448 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.98 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.97 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 444 aa  150  6e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.15 
 
 		 451 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1225  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.874219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.42 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.18 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  30.77 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.64 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  26.23 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  24.1 
 
 		 461 aa  139  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 447 aa  133  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 470 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  28.63 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  26.67 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.38 
 
 		 451 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.37 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  29.11 
 
 		 466 aa  123  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  23.4 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 439 aa  120  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>