More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2400 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  58.1 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  49.78 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  52.25 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  56.83 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  50.91 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  53.17 
 
 		 242 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  52.66 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  56.98 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.2 
 
 		 277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  48.2 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  50.9 
 
 		 260 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  58.52 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  55.11 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  54.55 
 
 		 201 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  54.92 
 
 		 213 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  52.84 
 
 		 201 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  50.8 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  54.75 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  52.73 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  51.82 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  53.67 
 
 		 207 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  52.27 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  51.36 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.27 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  52.73 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  52.73 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  42.06 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  42.06 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.7 
 
 		 207 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  51.7 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  52.84 
 
 		 207 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  47.96 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  50 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50.57 
 
 		 208 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  52.27 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  55.87 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  44.34 
 
 		 338 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  45 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  50.91 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  43.6 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  46.24 
 
 		 209 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  49.73 
 
 		 198 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  49.43 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  50 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  50.45 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  51.87 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  40.73 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  52.04 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  50.57 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  44.34 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  41.53 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 198 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 198 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  48.11 
 
 		 198 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 198 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  43.11 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  51.14 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  49.19 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 198 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 197 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  47.62 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.8 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  50.54 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 198 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  52.3 
 
 		 198 aa  168  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  49.44 
 
 		 197 aa  168  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  47.32 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  49.73 
 
 		 202 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  48.26 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>