More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2362 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  521  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  45.24 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  45.78 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  45.06 
 
 		 235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  46.8 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  42.34 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  44.4 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  41.2 
 
 		 230 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  43.43 
 
 		 230 aa  198  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  41.94 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.52 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  42.4 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  41.46 
 
 		 225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  42.57 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  41.67 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  39.6 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  44.84 
 
 		 202 aa  191  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.2 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  41.43 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  42.8 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.17 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  42.91 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  41.11 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  43.42 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  41.2 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  41.27 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 		 227 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  40.96 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  42.73 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  42.57 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  39.76 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  41.3 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  42.74 
 
 		 220 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  38.96 
 
 		 225 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  38.71 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  39.84 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  36.9 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  35.48 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  40.73 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  38.96 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.35 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.15 
 
 		 276 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  39.73 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  37.1 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  37.94 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  40.61 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  39.53 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  38.96 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  36.9 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  35.6 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  37.9 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  36.11 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  36.11 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  38.65 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  36.4 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  38.8 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  35.89 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  36.44 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  34.8 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  36.8 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1883  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  35.63 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  36.65 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  38.37 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  38.37 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  35.41 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  33.87 
 
 		 229 aa  162  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  38.12 
 
 		 227 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  38.05 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  36.76 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  36.76 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  39.26 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  36.76 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  35.08 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  36.76 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.76 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  36.76 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  36.76 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  36.76 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  36.76 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  38.12 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  35.57 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  35.43 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  34.26 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  36.64 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  35.32 
 
 		 228 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  36.65 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  39.46 
 
 		 216 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  35.77 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  36.22 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  36.65 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  34.52 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  34.92 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  37.35 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4030  alanine racemase domain-containing protein  35.71 
 
 		 235 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  36.03 
 
 		 240 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  34.14 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  34.26 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>