40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2354 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2354  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000228636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0376  CopY family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0429  CopY family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  32.69 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3145  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3470  transcriptional repressor, CopY family  28.97 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1589  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2098  transcriptional repressor, CopY family  28.3 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0165  transcriptional repressor, CopY family  26.42 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.272376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  32.08 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  28.97 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0730  transcriptional repressor, CopY family  27.36 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  28.3 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  26.67 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  30.84 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  29.91 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  28.97 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  26.42 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  26.42 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  29.91 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  37.93 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  24.77 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  28.04 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  28.04 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  29.52 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  24.76 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  24.76 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  20.91 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  23.64 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  20.18 
 
 		 124 aa  40  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>