More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2327 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
164 aa  340  7e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  56.96 
 
 
159 aa  190  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  39.04 
 
 
185 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  35.85 
 
 
176 aa  97.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  35.85 
 
 
176 aa  97.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  38.62 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  37.16 
 
 
188 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
172 aa  94.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 
168 aa  94.4  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  34.51 
 
 
188 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  36.09 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
174 aa  92  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.52 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.33 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.56 
 
 
187 aa  91.3  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  34.64 
 
 
187 aa  90.9  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  39.26 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
171 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  36.55 
 
 
170 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  34.01 
 
 
167 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  34.62 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  35.14 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
160 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 
159 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
180 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  35.38 
 
 
169 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  34.87 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  35.1 
 
 
187 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  31.72 
 
 
180 aa  87.8  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 
248 aa  87.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
160 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  34.87 
 
 
189 aa  87  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  37.8 
 
 
143 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 
135 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  38.74 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 
135 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  35.61 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 
135 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  35.61 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  36.64 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 
162 aa  84.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  36.64 
 
 
163 aa  84.3  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  39.66 
 
 
120 aa  84.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  39.66 
 
 
120 aa  84.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  36.92 
 
 
146 aa  84.3  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  36.92 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  36.75 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  34.46 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.82 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  33.33 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.06 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  38.06 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  38.06 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.06 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.06 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  39.8 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.09 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  39.8 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  34.46 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  34.46 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  35.43 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  35.43 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  34.64 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.99 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2687  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.793889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>