249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2313 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 345 aa  697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.07 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.24 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.24 
 
 		 343 aa  255  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.04 
 
 		 347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  36.81 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  36.81 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.13 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.09 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.57 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.57 
 
 		 341 aa  222  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.3 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.52 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.17 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.45 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.75 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  35.84 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  35.84 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.64 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  35.55 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  35.55 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  35.55 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.74 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  35.55 
 
 		 338 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  35.55 
 
 		 338 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.54 
 
 		 344 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  35.55 
 
 		 338 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  35.26 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.91 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  34.68 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.03 
 
 		 351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.65 
 
 		 343 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  35.03 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.73 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 343 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.11 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.17 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  35.76 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.01 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.86 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  31.42 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  32.46 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  31.12 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  34.99 
 
 		 352 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  34.49 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  29.09 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  34.5 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  33.94 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.73 
 
 		 344 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  30.83 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  34.21 
 
 		 337 aa  189  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  34.33 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  32.29 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.83 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  34.04 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  33.53 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  33.84 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  34.55 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.27 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  31.46 
 
 		 360 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  32.23 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  32.34 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  32.34 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  32.34 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.7 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.78 
 
 		 340 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.43 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  32.12 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  32.12 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.21 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  33.54 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  29.86 
 
 		 339 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.31 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  31.59 
 
 		 339 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  32.52 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.95 
 
 		 354 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  31.6 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.02 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  32.93 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  32.16 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 		 355 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.28 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  29.94 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.63 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>