More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2294 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  60.94 
 
 
555 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  56.7 
 
 
559 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  55.72 
 
 
554 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  55.56 
 
 
555 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  58.73 
 
 
555 aa  678    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  56.44 
 
 
558 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  54.1 
 
 
554 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  57.79 
 
 
554 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  56.14 
 
 
554 aa  660    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  58.33 
 
 
555 aa  682    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  58.33 
 
 
555 aa  679    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  54.83 
 
 
553 aa  641    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
618 aa  1267    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  59.78 
 
 
560 aa  712    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  62.32 
 
 
555 aa  719    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  50.82 
 
 
553 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  53.45 
 
 
566 aa  604  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  50.46 
 
 
560 aa  595  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  50.55 
 
 
558 aa  596  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  50.18 
 
 
558 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  49.73 
 
 
551 aa  591  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  49.82 
 
 
558 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.28 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.1 
 
 
557 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  49.1 
 
 
557 aa  579  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  48.92 
 
 
557 aa  578  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  49.46 
 
 
557 aa  581  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  49.19 
 
 
558 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  48.92 
 
 
557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.1 
 
 
557 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.74 
 
 
557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  51.73 
 
 
555 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  50.27 
 
 
555 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  50.27 
 
 
555 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  50.27 
 
 
555 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  50.27 
 
 
555 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  50.27 
 
 
555 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  50.27 
 
 
555 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  50.46 
 
 
555 aa  570  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  50.27 
 
 
555 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  50.27 
 
 
555 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  50.09 
 
 
555 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  50.27 
 
 
555 aa  568  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  48.88 
 
 
533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  50.09 
 
 
555 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  48.55 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  47.83 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  48.55 
 
 
583 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  48 
 
 
556 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  48.18 
 
 
556 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  48 
 
 
556 aa  558  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  48 
 
 
556 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  48 
 
 
556 aa  558  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  48 
 
 
556 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  48 
 
 
556 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  48 
 
 
556 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  48 
 
 
556 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  47.36 
 
 
569 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  48.36 
 
 
552 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  49.45 
 
 
560 aa  546  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  48.29 
 
 
551 aa  543  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  48.47 
 
 
551 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  48.47 
 
 
551 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  48.73 
 
 
565 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  48.73 
 
 
565 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  44.44 
 
 
547 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  47.55 
 
 
553 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  45.95 
 
 
560 aa  532  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  44.86 
 
 
593 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  47.36 
 
 
555 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  46.52 
 
 
561 aa  531  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  47.11 
 
 
548 aa  527  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  46.86 
 
 
557 aa  528  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  46.7 
 
 
561 aa  528  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  47.12 
 
 
591 aa  524  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.54 
 
 
555 aa  524  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.99 
 
 
573 aa  523  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  47.13 
 
 
561 aa  522  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  45.52 
 
 
561 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  44.19 
 
 
569 aa  517  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.25 
 
 
560 aa  514  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  45.26 
 
 
556 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.16 
 
 
559 aa  499  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.65 
 
 
564 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  46.28 
 
 
559 aa  501  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  43.3 
 
 
556 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0755  beta-lactamase domain protein  43.5 
 
 
602 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  43.43 
 
 
572 aa  485  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  43.17 
 
 
588 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  42.35 
 
 
561 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  43.17 
 
 
588 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.09 
 
 
561 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  42 
 
 
549 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  41.05 
 
 
556 aa  475  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  41.25 
 
 
562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  42.23 
 
 
677 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.21 
 
 
561 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  42.2 
 
 
561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  42.58 
 
 
554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  42.78 
 
 
664 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>