More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2284 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  53.98 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  49.41 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  45.83 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  42.19 
 
 		 200 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  42.19 
 
 		 200 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  39.66 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  39.41 
 
 		 173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  40.74 
 
 		 190 aa  118  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  36.32 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  35.64 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0427  Signal peptidase I  41.67 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  40.59 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  41.46 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0432  signal peptidase I  41.48 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0849039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  40.61 
 
 		 193 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  37.8 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  37.06 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  40.68 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  42.42 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  42.48 
 
 		 171 aa  112  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  37.5 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  39.58 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  34.1 
 
 		 216 aa  111  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  39.24 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  33.67 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  41.67 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  37.21 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  32.62 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  42.76 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  37.35 
 
 		 209 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  39.61 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  34.78 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  40.85 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  33.33 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.81 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  33.66 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  35.11 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  40.49 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.53 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  41.25 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.63 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  34.32 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  38.85 
 
 		 173 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  32.73 
 
 		 225 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0578  signal peptidase I  41.14 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  33.16 
 
 		 219 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  35.1 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  43.04 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0564  signal peptidase I  41.71 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  40.49 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.04 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  35.83 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  32.73 
 
 		 259 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  26.39 
 
 		 249 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2462  signal peptidase I  35.26 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  34.27 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  42.36 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  32.47 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  32.74 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  32.78 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.84 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  33.13 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  35.6 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  32.02 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  31.28 
 
 		 267 aa  95.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  29.92 
 
 		 297 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  33.85 
 
 		 288 aa  95.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  29.19 
 
 		 262 aa  94.7  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  29.91 
 
 		 260 aa  94.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  33.18 
 
 		 291 aa  94.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  30.85 
 
 		 263 aa  94.4  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  33.68 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  29.92 
 
 		 297 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  29.92 
 
 		 297 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  32.56 
 
 		 236 aa  94.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  29.92 
 
 		 297 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  39.47 
 
 		 243 aa  94.4  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  28.64 
 
 		 247 aa  94.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  32.98 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  30.74 
 
 		 297 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  45.45 
 
 		 243 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  30.81 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  45.3 
 
 		 271 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  29.11 
 
 		 260 aa  93.2  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.88 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  34.97 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  28.64 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  32.78 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  29.11 
 
 		 260 aa  93.2  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  41.04 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  31.15 
 
 		 267 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  30.24 
 
 		 275 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  41.04 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  34.04 
 
 		 248 aa  91.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  29.85 
 
 		 233 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.46 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  31.67 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  31.67 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  31.67 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>