217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2274 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2274  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 1012 aa  2089    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  38.02 
 
 		 951 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  37.14 
 
 		 961 aa  612  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0089  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 951 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0294  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 998 aa  292  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 424 aa  80.9  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.29 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.54 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.82 
 
 		 366 aa  67.8  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 		 440 aa  67  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.37 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  22.69 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 428 aa  64.3  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.51 
 
 		 406 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 419 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 417 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 422 aa  60.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 411 aa  60.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.68 
 
 		 422 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.68 
 
 		 422 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 422 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 432 aa  61.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 424 aa  60.1  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.93 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5331  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.72 
 
 		 431 aa  57.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.998389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 468 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 445 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 464 aa  56.2  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 412 aa  56.2  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0041  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 460 aa  55.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.96 
 
 		 421 aa  55.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  22.75 
 
 		 409 aa  55.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 446 aa  55.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.63 
 
 		 422 aa  55.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 436 aa  55.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 414 aa  55.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 504 aa  55.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 425 aa  54.7  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  24.03 
 
 		 464 aa  54.3  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 440 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 437 aa  54.3  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3553  hypothetical protein  21.26 
 
 		 427 aa  54.3  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 420 aa  54.3  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.15 
 
 		 422 aa  54.3  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.34 
 
 		 444 aa  53.5  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 415 aa  53.5  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 423 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.62 
 
 		 431 aa  52.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 436 aa  52.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 414 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 434 aa  52.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 439 aa  52.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  20.39 
 
 		 403 aa  52.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 438 aa  52.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.58 
 
 		 420 aa  52.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  21.31 
 
 		 427 aa  52.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 497 aa  52.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.1 
 
 		 438 aa  52  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 419 aa  52  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  20.49 
 
 		 420 aa  52  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 395 aa  52  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.93 
 
 		 430 aa  52  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 430 aa  51.6  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  19.93 
 
 		 441 aa  51.6  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 		 446 aa  51.6  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 		 412 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 422 aa  51.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 447 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 434 aa  50.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.63 
 
 		 496 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  21.75 
 
 		 425 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 455 aa  50.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 445 aa  50.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 441 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 422 aa  50.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 435 aa  50.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 414 aa  50.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 426 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>