168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2181 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  100 
 
 		 346 aa  723    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  61.7 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1162  Threonine aldolase  56.3 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0005  L-threonine aldolase, low-specificity  53.04 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  52.2 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  52.66 
 
 		 341 aa  359  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2927  Threonine aldolase  51.31 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1377  hypothetical protein  52.66 
 
 		 351 aa  359  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1404  hypothetical protein  52.66 
 
 		 351 aa  359  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.265494  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1756  hypothetical protein  51.63 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08120  L-threonine aldolase  51.17 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000672977  hitchhiker  0.0000000548027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  48.97 
 
 		 339 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  47.81 
 
 		 342 aa  329  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  48.37 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0857  threonine aldolase  46.15 
 
 		 341 aa  317  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  40.52 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04194  threonine aldolase  48.91 
 
 		 282 aa  255  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0300  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.18 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  32.54 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  32.65 
 
 		 359 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  32.65 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  31.12 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  33.14 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  32.16 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  31.96 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  32.76 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  32.76 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  32.76 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  31.27 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  31.12 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  30.99 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  29.89 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  30.61 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  30.61 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.09 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  29.68 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  30.99 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  28.65 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  30.32 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  29.8 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  31.14 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  30.43 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  30.45 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  29.31 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  30.21 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  28.45 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  30.15 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  31.34 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  29.6 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  29.6 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  28.82 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  28.82 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  29.33 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  28.57 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  29.53 
 
 		 369 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  27.38 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  28.53 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  29.38 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  29.8 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  26.74 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  29.15 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  28.86 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  28.9 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  29.68 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  27.38 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  29.57 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  28.61 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  28.45 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  28.45 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  27.95 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  27.14 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  26.59 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  29.35 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  26.7 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  28.57 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  27.7 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  29.45 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  28.74 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  29.23 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  28.12 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  28.12 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  28.12 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  27.54 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  25.57 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  26.38 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  25.7 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  29.63 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  25.43 
 
 		 343 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  27.64 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  25.57 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  29.11 
 
 		 340 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  28.37 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  25.96 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  26.78 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  26.38 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  27.94 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.59 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  25.72 
 
 		 350 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  26.96 
 
 		 338 aa  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  27.07 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>