27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2105 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 
212 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  80.19 
 
 
212 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  65 
 
 
338 aa  223  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  56.16 
 
 
428 aa  220  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  56.02 
 
 
334 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  64 
 
 
338 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  56.07 
 
 
333 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  63.64 
 
 
1001 aa  215  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  63.33 
 
 
343 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  63.07 
 
 
692 aa  211  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  56.93 
 
 
221 aa  209  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  55.12 
 
 
494 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  61.45 
 
 
380 aa  208  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  60.99 
 
 
225 aa  207  7e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  60.22 
 
 
767 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  50.45 
 
 
233 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  47.25 
 
 
1160 aa  191  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  51.41 
 
 
411 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  51.2 
 
 
524 aa  171  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  46.4 
 
 
357 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  47.06 
 
 
683 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  47.09 
 
 
298 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  48.47 
 
 
356 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  38.61 
 
 
337 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  39.07 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  32 
 
 
274 aa  81.6  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0701  UDP-glucose 4-epimerase  32.02 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.399918  normal  0.0107681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>