54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2026 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2026  glycoside hydrolase family 42 protein  100 
 
 		 326 aa  682    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0289  glycoside hydrolase family 42 protein  57.64 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0613274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  37.22 
 
 		 1013 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.6 
 
 		 1005 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  32.59 
 
 		 1023 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  30.87 
 
 		 1026 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  30.94 
 
 		 1008 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  32.27 
 
 		 1012 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  28.05 
 
 		 1455 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  23.17 
 
 		 1049 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  25.96 
 
 		 1084 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 1084 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  26.1 
 
 		 1108 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1950  beta-galactosidase  40.54 
 
 		 103 aa  77.8  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  26.65 
 
 		 1059 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  24.76 
 
 		 1019 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 		 1043 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.76 
 
 		 1030 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.96 
 
 		 1264 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  20.75 
 
 		 1112 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 1077 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.09 
 
 		 1026 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  22.71 
 
 		 1079 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  24.6 
 
 		 1129 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 1094 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  23.57 
 
 		 1164 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  23.7 
 
 		 1012 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  22.61 
 
 		 1045 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  23.45 
 
 		 1009 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  24.64 
 
 		 1046 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.18 
 
 		 1289 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  21.38 
 
 		 1044 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.05 
 
 		 1053 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  24.85 
 
 		 1024 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 		 1045 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.52 
 
 		 1424 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  21.82 
 
 		 1036 aa  53.1  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46582  predicted protein  28.72 
 
 		 561 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.59 
 
 		 968 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.7 
 
 		 1033 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  23.39 
 
 		 1030 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  22.6 
 
 		 1076 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  23.64 
 
 		 1041 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  22.29 
 
 		 1031 aa  49.7  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  23.32 
 
 		 1030 aa  49.3  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.57 
 
 		 1036 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.1 
 
 		 1329 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  23.59 
 
 		 1035 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.76 
 
 		 1033 aa  45.8  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.52 
 
 		 1018 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  23.12 
 
 		 1036 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  19.74 
 
 		 1035 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  23.59 
 
 		 1063 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  20.98 
 
 		 1032 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>