62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1975 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 730 aa  1488    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  29.77 
 
 		 1882 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1052 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  25.05 
 
 		 1842 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  26.35 
 
 		 460 aa  125  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  24.38 
 
 		 1518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  28.27 
 
 		 395 aa  116  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 589 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  23.05 
 
 		 1732 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  27.01 
 
 		 456 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  27.24 
 
 		 2392 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 399 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  25.4 
 
 		 476 aa  100  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  27.29 
 
 		 458 aa  97.8  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  28.17 
 
 		 355 aa  95.5  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  31.62 
 
 		 352 aa  93.6  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  24.71 
 
 		 2495 aa  92  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  28.77 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  27.6 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1247 aa  82  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  40 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  29.79 
 
 		 691 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  35.04 
 
 		 231 aa  72  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  38.68 
 
 		 285 aa  70.1  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  32.56 
 
 		 203 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  30.3 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  42.98 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  32.82 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  32.18 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  36.97 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  32.32 
 
 		 158 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  34.18 
 
 		 1009 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  22.92 
 
 		 538 aa  62.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  30.56 
 
 		 237 aa  63.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  36.6 
 
 		 1821 aa  62  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  37.31 
 
 		 4630 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  21.17 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  31.74 
 
 		 213 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1118 aa  59.7  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  30.87 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  34.75 
 
 		 437 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  25.43 
 
 		 254 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  27.21 
 
 		 1279 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  28.19 
 
 		 278 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  32.2 
 
 		 1300 aa  54.7  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  42.42 
 
 		 262 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  40.24 
 
 		 390 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2588  hypothetical protein  36.89 
 
 		 195 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  27.37 
 
 		 657 aa  52  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  33.86 
 
 		 570 aa  52  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  27.37 
 
 		 434 aa  50.8  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  32.54 
 
 		 1421 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  23.12 
 
 		 271 aa  48.1  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  27.56 
 
 		 1361 aa  47.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  29.49 
 
 		 297 aa  47.4  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  30.89 
 
 		 506 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  28.15 
 
 		 576 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  29.27 
 
 		 799 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  24.02 
 
 		 225 aa  45.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  30.99 
 
 		 380 aa  45.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  26.51 
 
 		 270 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  31.01 
 
 		 981 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>