More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1928 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
223 aa  446  1e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  41.23 
 
 
217 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  40.67 
 
 
233 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  38.39 
 
 
221 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  38.39 
 
 
221 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  38.39 
 
 
221 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  38.39 
 
 
221 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  38.39 
 
 
221 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  38.39 
 
 
221 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  38.39 
 
 
221 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  38.39 
 
 
221 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  38.39 
 
 
221 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  36.02 
 
 
215 aa  157  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  38.39 
 
 
221 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  37.21 
 
 
220 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  37.21 
 
 
220 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  38.39 
 
 
221 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.38081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  38.36 
 
 
221 aa  155  5e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  38.36 
 
 
221 aa  154  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  34.6 
 
 
220 aa  151  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00527e-08  hitchhiker  1.67844e-14 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  38.1 
 
 
215 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.26197e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  39.07 
 
 
217 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  35.35 
 
 
219 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  37.56 
 
 
220 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  35.55 
 
 
218 aa  146  2e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  38.79 
 
 
221 aa  144  8e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  38.39 
 
 
217 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.38787e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  36.67 
 
 
217 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.30553e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  38.21 
 
 
221 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  33.94 
 
 
227 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  34.43 
 
 
218 aa  139  4e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  37.75 
 
 
219 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  34.93 
 
 
217 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  34.62 
 
 
220 aa  132  4e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  34.13 
 
 
220 aa  131  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  32.37 
 
 
222 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  35.81 
 
 
217 aa  129  4e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  36.28 
 
 
232 aa  129  5e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  32.55 
 
 
225 aa  129  5e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  35.98 
 
 
217 aa  128  5e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  35.21 
 
 
219 aa  128  7e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
223 aa  127  1e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  31.4 
 
 
224 aa  127  2e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  32.54 
 
 
222 aa  126  2e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  33.01 
 
 
222 aa  127  2e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 
217 aa  126  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  35.55 
 
 
213 aa  125  4e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  34.72 
 
 
231 aa  125  4e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  29.22 
 
 
220 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  30.92 
 
 
221 aa  124  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  30.95 
 
 
224 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  29.36 
 
 
223 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  31.02 
 
 
223 aa  123  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  31.92 
 
 
216 aa  122  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  35.75 
 
 
231 aa  121  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  33.49 
 
 
231 aa  120  1e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  30.14 
 
 
225 aa  119  2e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  33.03 
 
 
218 aa  120  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 
222 aa  119  2e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  32.85 
 
 
235 aa  120  2e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  7.19315e-05 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  29.67 
 
 
228 aa  119  4e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  31.67 
 
 
224 aa  119  4e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  31.43 
 
 
220 aa  119  4e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 
228 aa  119  5e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  33.01 
 
 
217 aa  118  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  31.4 
 
 
220 aa  118  8e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 
229 aa  118  8e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 
229 aa  118  8e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  32.7 
 
 
220 aa  117  1e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  30.48 
 
 
218 aa  117  1e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 
221 aa  117  1e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  31.9 
 
 
224 aa  117  2e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  33.94 
 
 
216 aa  117  2e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  33 
 
 
216 aa  116  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 
220 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 
224 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  34.26 
 
 
250 aa  115  4e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  33.49 
 
 
216 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  33.49 
 
 
216 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 
227 aa  114  8e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 
219 aa  114  1e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 
221 aa  113  2e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  33.8 
 
 
234 aa  113  2e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 
230 aa  112  4e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  32.88 
 
 
234 aa  112  4e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 
222 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  32.88 
 
 
234 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  32.88 
 
 
234 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0350  K+ transport system, NAD-binding component  31.34 
 
 
223 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.53262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 
221 aa  111  7e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  31.3 
 
 
230 aa  111  7e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  33.18 
 
 
234 aa  111  8e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1833  TrkA-N domain protein  32.65 
 
 
244 aa  110  2e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 
222 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 
222 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 
213 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  30.19 
 
 
232 aa  108  8e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  30.48 
 
 
216 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  33.33 
 
 
234 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>