More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1915 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 775 aa  1577    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 760 aa  346  8e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0342  AraC family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 778 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  21.1 
 
 		 542 aa  90.1  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 793 aa  90.5  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  22.36 
 
 		 546 aa  88.2  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  23.06 
 
 		 538 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  24.44 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 766 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 544 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 548 aa  82.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  22.08 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  37.23 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  21.2 
 
 		 544 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 1201 aa  74.7  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 773 aa  74.7  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 315 aa  73.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  30.82 
 
 		 308 aa  73.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 719 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 290 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  31.91 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  31.96 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1706  AraC family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 778 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0404668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  20.56 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0066  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  40.43 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  31.91 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1400  transcriptional regulator, AraC family  25.35 
 
 		 329 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301522  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1048  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 101 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000208047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  20.83 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2607  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.634815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  30.41 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.9 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  35.14 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  27.84 
 
 		 287 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  19.33 
 
 		 779 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  33.08 
 
 		 507 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  33.08 
 
 		 507 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  27.84 
 
 		 301 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 321 aa  67  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 302 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 259 aa  66.6  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 409 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 310 aa  66.6  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 301 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.93 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  29.71 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05000  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  28.28 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.989106  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5414  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00395268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6000  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  18.99 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2055  two component transcriptional regulator, AraC family  22.65 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.11 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  33.65 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  23.84 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1497  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 267 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 318 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 285 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>