More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1900 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
188 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
226 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
226 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
209 aa  114  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 
214 aa  111  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.07 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 
223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35.71 
 
 
227 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  36.78 
 
 
207 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
206 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
214 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  36.81 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.26 
 
 
229 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
217 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  36.21 
 
 
207 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  36.59 
 
 
203 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
214 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 
221 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
223 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.8 
 
 
229 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
223 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.26 
 
 
220 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
221 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
221 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.26 
 
 
220 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
205 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  27.57 
 
 
197 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
220 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
449 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 
220 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.42 
 
 
442 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  31.72 
 
 
229 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.95 
 
 
442 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
217 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 
220 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
208 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
220 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
220 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
220 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  35.37 
 
 
205 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  35.37 
 
 
203 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
214 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
240 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 
445 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  34.76 
 
 
203 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 
223 aa  101  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
214 aa  101  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
223 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  34.76 
 
 
203 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.02 
 
 
442 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
207 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
202 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.76 
 
 
442 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  34.15 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.33 
 
 
443 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.95 
 
 
442 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  34.15 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
213 aa  99  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.87 
 
 
442 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
240 aa  99  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
229 aa  98.2  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  34.16 
 
 
203 aa  97.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
459 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.15 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
197 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
198 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.48 
 
 
442 aa  97.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.39 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 
447 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
207 aa  96.3  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
211 aa  96.3  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 
213 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
197 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.43 
 
 
444 aa  95.5  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
201 aa  94.7  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
201 aa  94.7  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
213 aa  94.4  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  28.96 
 
 
223 aa  94.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
448 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 
215 aa  93.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
212 aa  94  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
233 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
448 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
215 aa  92.8  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  28.49 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
215 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
447 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>