126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1896 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1896  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 73 aa  152  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 484 aa  80.5  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 		 510 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  44.29 
 
 		 496 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  39.13 
 
 		 586 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 498 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  40.58 
 
 		 523 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 500 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  38.03 
 
 		 500 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2408  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 		 563 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410244  normal  0.0736984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  39.34 
 
 		 499 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  39.34 
 
 		 499 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 515 aa  50.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  46.94 
 
 		 507 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  40.32 
 
 		 503 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  44.9 
 
 		 501 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  38.03 
 
 		 525 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  35.71 
 
 		 542 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 503 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  46.3 
 
 		 417 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  46.3 
 
 		 417 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  46.3 
 
 		 417 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  42.86 
 
 		 501 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  45.83 
 
 		 501 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.3 
 
 		 417 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  46.3 
 
 		 417 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  36.84 
 
 		 509 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.3 
 
 		 417 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  43.75 
 
 		 938 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  40 
 
 		 505 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  40 
 
 		 505 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  42.86 
 
 		 501 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  38.78 
 
 		 505 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  40.68 
 
 		 523 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  41.07 
 
 		 501 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  34.72 
 
 		 598 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  35.62 
 
 		 509 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  38.33 
 
 		 517 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  35.9 
 
 		 509 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  39.62 
 
 		 548 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.62 
 
 		 643 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  35.59 
 
 		 499 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  41.51 
 
 		 506 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  35 
 
 		 505 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  38.78 
 
 		 503 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 496 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  40.82 
 
 		 522 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  41.43 
 
 		 495 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  50 
 
 		 417 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  36.73 
 
 		 508 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  40 
 
 		 445 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  48.89 
 
 		 647 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  48.89 
 
 		 647 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  37.25 
 
 		 494 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  50 
 
 		 431 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  34.55 
 
 		 536 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  38 
 
 		 489 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  35.29 
 
 		 493 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  37.7 
 
 		 1293 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  36.54 
 
 		 497 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  31.94 
 
 		 492 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 502 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  58.33 
 
 		 463 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  44 
 
 		 435 aa  42.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  31.67 
 
 		 504 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  45.83 
 
 		 507 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  30.43 
 
 		 519 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  36.36 
 
 		 527 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  45.1 
 
 		 469 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  40 
 
 		 503 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 891 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 397 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  37.04 
 
 		 566 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  38 
 
 		 505 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  31.82 
 
 		 465 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  36.62 
 
 		 511 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  32.79 
 
 		 432 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  38.57 
 
 		 471 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  32.35 
 
 		 498 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.35 
 
 		 740 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 		 642 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.22 
 
 		 639 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.62 
 
 		 640 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  47.62 
 
 		 645 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  35.71 
 
 		 493 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  27.27 
 
 		 488 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  44.19 
 
 		 461 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  42.22 
 
 		 476 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1577  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  50 
 
 		 463 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00876863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  34.55 
 
 		 468 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  40 
 
 		 504 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3575  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  43.24 
 
 		 736 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  44.19 
 
 		 460 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.89 
 
 		 602 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  44.23 
 
 		 482 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  35.62 
 
 		 509 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  32.73 
 
 		 468 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  40.74 
 
 		 500 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  52.63 
 
 		 1150 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>