152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1894 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  38.83 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  36.27 
 
 		 226 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  35.29 
 
 		 226 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  36.76 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  35.78 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  35.47 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  32.52 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  33.82 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  34.98 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  35.47 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  35.47 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  34.39 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  34.04 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  34.03 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  34.03 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  35.96 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  34.13 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  36.76 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  34.31 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  33.66 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  34.76 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  30.85 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  31.5 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  32.18 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  32.2 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  32.18 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  31.19 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  31.53 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  32.2 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  32.04 
 
 		 209 aa  99  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  32.67 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  32.47 
 
 		 213 aa  98.6  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  32.18 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  32.18 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  32.2 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  31.73 
 
 		 216 aa  97.8  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  32.2 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  30.88 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  29.7 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  30.73 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  32.18 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  29.7 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  31.19 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  30.39 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  29.9 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  29.9 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  28.92 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  30.85 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  29.21 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  29.21 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  29.61 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  29.21 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  29.21 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  29.21 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  29.21 
 
 		 213 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  28.22 
 
 		 255 aa  91.3  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  28.71 
 
 		 242 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  28.71 
 
 		 242 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  29.13 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  34.17 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  28.71 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  28.71 
 
 		 212 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  28.22 
 
 		 242 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  30.98 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  29.7 
 
 		 209 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  29.13 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  28.29 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  28.08 
 
 		 219 aa  84.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  29.21 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  31.07 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  26.73 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  31.43 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  27.59 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  27.59 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  27.85 
 
 		 243 aa  77.8  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.95 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  30.09 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  26.79 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.77 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  30.29 
 
 		 217 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  25.5 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  26.53 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  28.91 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  26.09 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.75 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  27.75 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.98 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  27.45 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  30.11 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  28.44 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  30.33 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  31.1 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  27.75 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  25.12 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.97 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  28.23 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  29.08 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>