34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1872 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  100 
 
 
319 aa  664    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  25.79 
 
 
323 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  25.79 
 
 
323 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  25.4 
 
 
323 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  25.79 
 
 
323 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  25.4 
 
 
323 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  25.79 
 
 
323 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  25.59 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  26.18 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  25.64 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  24.89 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  26.56 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  29.24 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  27.62 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  27.62 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  28.33 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  28.33 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  26.89 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  24.81 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  20.98 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  22.52 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  19.38 
 
 
347 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  19.43 
 
 
322 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  22.67 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  19.46 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  18.73 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  21.84 
 
 
346 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  24.06 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  26.96 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  21.02 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  25.21 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  21.28 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  21.46 
 
 
298 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  27.03 
 
 
352 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>