More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1869 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
117 aa  240  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.74 
 
 
123 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  40.82 
 
 
102 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  50 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  48.19 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  50 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  47.25 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  50 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.89 
 
 
142 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  48.68 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.68 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  48.68 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  43.33 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.87 
 
 
566 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.87 
 
 
566 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  38.39 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.94 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  47.37 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  41.56 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  47.89 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  47.89 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  47.89 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  39.25 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  47.37 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  47.37 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  47.37 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  47.37 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  47.37 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  46.25 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  47.37 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  47.37 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  40.91 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  47.89 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  40.91 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.35 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  40.2 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
278 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  40.2 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  39.74 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  40.45 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  41.67 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  48.75 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  39.29 
 
 
201 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.59 
 
 
393 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  38.95 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  45.98 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  43.42 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  37.08 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  41.67 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.37 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  44.74 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  40.48 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  41.56 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  44.74 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  44.74 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  44.74 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  42.11 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.78 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>