145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1856 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1856  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0072  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 172 aa  51.2  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0094  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 229 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  36.54 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  25.51 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0874  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0891  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0880  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 72 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 291 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 295 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  20.71 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  42.55 
 
 		 219 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  35.85 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 286 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  35.85 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  26.05 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 210 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  24.14 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 187 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 223 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 197 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 202 aa  42  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>