175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1775 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 2117 aa  4304    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.45 
 
 		 734 aa  510  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  45.64 
 
 		 850 aa  479  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.83 
 
 		 962 aa  472  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.81 
 
 		 722 aa  463  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  45.5 
 
 		 732 aa  456  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  43.56 
 
 		 918 aa  450  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1676  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.05 
 
 		 648 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0398  secreted protein  42.78 
 
 		 640 aa  429  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0054  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.43 
 
 		 537 aa  414  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.77 
 
 		 755 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6657  secreted protein  42.16 
 
 		 645 aa  410  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1385  secreted protein  41.23 
 
 		 627 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.195328  decreased coverage  0.000365007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.19 
 
 		 940 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2395  Fibronectin type III domain protein  42.09 
 
 		 844 aa  406  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527977  decreased coverage  0.000101055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3740  secreted protein  40.93 
 
 		 640 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253884  hitchhiker  0.00713649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1669  secreted protein  40.75 
 
 		 622 aa  379  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180028  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1718  secreted protein  40.82 
 
 		 562 aa  374  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.644639  normal  0.917754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0200  hypothetical protein  35.81 
 
 		 726 aa  367  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2668  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.07 
 
 		 652 aa  363  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5709  hypothetical protein  34.69 
 
 		 722 aa  355  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  31.38 
 
 		 1421 aa  172  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 		 1321 aa  143  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  29.76 
 
 		 1710 aa  141  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  25.18 
 
 		 1081 aa  123  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0275  S-layer domain protein  25.17 
 
 		 830 aa  108  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.44 
 
 		 915 aa  102  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  27.86 
 
 		 758 aa  97.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  36.22 
 
 		 1581 aa  96.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.71 
 
 		 1059 aa  86.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  29.32 
 
 		 4630 aa  81.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  42.31 
 
 		 801 aa  79.7  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.14 
 
 		 756 aa  79.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.93 
 
 		 1158 aa  78.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.73 
 
 		 674 aa  78.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.41 
 
 		 729 aa  78.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  40 
 
 		 819 aa  76.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  35.48 
 
 		 1441 aa  76.3  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  26.24 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.66 
 
 		 1007 aa  74.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  33.52 
 
 		 710 aa  74.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  31.72 
 
 		 932 aa  74.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  34.71 
 
 		 548 aa  74.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  31.32 
 
 		 1174 aa  72.8  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  40.95 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.83 
 
 		 953 aa  72.4  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  32.86 
 
 		 4013 aa  72.8  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  37.5 
 
 		 452 aa  72  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.71 
 
 		 1321 aa  70.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  29.94 
 
 		 518 aa  71.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 		 526 aa  71.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  36.19 
 
 		 571 aa  71.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  30.82 
 
 		 805 aa  70.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.73 
 
 		 1821 aa  70.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.94 
 
 		 542 aa  71.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.1 
 
 		 815 aa  70.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  36.29 
 
 		 475 aa  70.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  27.32 
 
 		 920 aa  70.1  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  39.78 
 
 		 752 aa  70.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  27.35 
 
 		 1226 aa  69.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.79 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  40 
 
 		 588 aa  69.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.06 
 
 		 639 aa  69.3  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.79 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  30.6 
 
 		 506 aa  68.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.24 
 
 		 471 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  27.68 
 
 		 660 aa  68.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 223 aa  67.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  28.43 
 
 		 926 aa  68.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.74 
 
 		 1564 aa  68.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.97 
 
 		 1362 aa  67  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.93 
 
 		 995 aa  67.4  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  31.31 
 
 		 685 aa  66.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.29 
 
 		 480 aa  67  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  33.33 
 
 		 487 aa  66.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  66.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  29.77 
 
 		 392 aa  66.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.27 
 
 		 637 aa  66.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  29.1 
 
 		 1847 aa  66.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  37.86 
 
 		 987 aa  66.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.93 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.44 
 
 		 578 aa  65.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  33.64 
 
 		 470 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.14 
 
 		 929 aa  64.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  33.81 
 
 		 732 aa  64.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 		 470 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 578 aa  63.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  28.35 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  26.52 
 
 		 834 aa  62.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  30.77 
 
 		 767 aa  62.8  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.13 
 
 		 581 aa  62.4  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  26.9 
 
 		 1154 aa  62.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  26.67 
 
 		 748 aa  62  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 631 aa  61.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.62 
 
 		 1117 aa  61.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  39.78 
 
 		 999 aa  60.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.51 
 
 		 971 aa  60.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  33.96 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  27.91 
 
 		 531 aa  59.7  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>