231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1759 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  37.95 
 
 
231 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  37.95 
 
 
231 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.01 
 
 
231 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  37.56 
 
 
231 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  38.46 
 
 
231 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  38.01 
 
 
231 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  38.01 
 
 
231 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.65 
 
 
231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.1 
 
 
231 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  36.21 
 
 
231 aa  148  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
242 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  36.2 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  31.53 
 
 
228 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  36.16 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.24 
 
 
227 aa  128  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  36.68 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  36.68 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.78 
 
 
225 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  32.16 
 
 
236 aa  124  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.24 
 
 
228 aa  124  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  34.68 
 
 
230 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  34.68 
 
 
230 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.17 
 
 
236 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  31.74 
 
 
236 aa  121  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.17 
 
 
236 aa  121  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.3 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.17 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  32.17 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  32.17 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
225 aa  119  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
225 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  31.3 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  31.3 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  31.11 
 
 
235 aa  115  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  33.49 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  31.08 
 
 
227 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  30.37 
 
 
238 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  31.31 
 
 
234 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  29.91 
 
 
238 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  30.37 
 
 
238 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  27.56 
 
 
224 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  30.22 
 
 
226 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  29.86 
 
 
245 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  29.86 
 
 
245 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  28.89 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  28.89 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  28.89 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  29.73 
 
 
245 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  29.78 
 
 
228 aa  99  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  26.79 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  25.34 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  25.34 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  25.34 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  25.34 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  25.34 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  29.44 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  27.18 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.16 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  26.67 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  26.87 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  25.79 
 
 
225 aa  92  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.79 
 
 
225 aa  92  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  25.79 
 
 
225 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  25.79 
 
 
225 aa  92  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  24.89 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  24.89 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  28.51 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  25.34 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  26.32 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  26.4 
 
 
230 aa  88.2  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  25.79 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  24.89 
 
 
225 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  27.15 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  24.89 
 
 
225 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.33 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  24.89 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  30.19 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.57 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.19 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.78 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.79 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  26.61 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  26.79 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  28.76 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.89 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  21.08 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  30.71 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.02 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  25.63 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  24.02 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  27.6 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  23.61 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  24.15 
 
 
300 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.77 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.55 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3065  HAD family hydrolase  28.68 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.643413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>