More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1674 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1674  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  707    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2369  hypothetical protein  38.36 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000132593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0199  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.29 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2372  hypothetical protein  33.79 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000519623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0773  Redoxin domain protein  28.77 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0090  Redoxin domain protein  30.54 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  31.43 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  31.06 
 
 		 179 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0089  Redoxin domain protein  30.65 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  32.59 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  29.29 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  30 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.96 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  28.57 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 269 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  31.3 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  32.5 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  33.93 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.64 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  32.48 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  32.48 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  32.48 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  32.48 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  32.48 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  32.48 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  30.93 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0098  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  30.61 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2010  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.35 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  28.78 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0096  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  30.61 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  34.04 
 
 		 183 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  27.59 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  29.17 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.45 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0107  Redoxin domain protein  31.61 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  28.87 
 
 		 194 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.67 
 
 		 184 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  32.5 
 
 		 183 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  29.03 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  32.5 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  30.77 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.09 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  30.93 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  32.53 
 
 		 195 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  27.73 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  27.73 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  27.73 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.4 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3658  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.57 
 
 		 196 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  27.73 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.53 
 
 		 195 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  32.65 
 
 		 194 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 179 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  42.37 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  30.25 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  31.3 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.62 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  28.48 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  25 
 
 		 180 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  32.23 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2789  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.53 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0340892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  31.25 
 
 		 173 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  31.67 
 
 		 183 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  32.5 
 
 		 183 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  27.68 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  26 
 
 		 195 aa  53.9  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  30.85 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  32.63 
 
 		 173 aa  53.9  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  27.85 
 
 		 191 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  27.5 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.04 
 
 		 187 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  30.83 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  30.83 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0110  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  29.17 
 
 		 193 aa  53.5  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.346566  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.87 
 
 		 194 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  30.5 
 
 		 203 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  30.5 
 
 		 203 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  30.5 
 
 		 203 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.87 
 
 		 194 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  27.73 
 
 		 184 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  27.73 
 
 		 184 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7128  hypothetical protein  28 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  27.59 
 
 		 191 aa  52.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  22.65 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  27.73 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.1 
 
 		 191 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  31.73 
 
 		 183 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4758  redoxin domain-containing protein  32.61 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  23.81 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  27.59 
 
 		 198 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  39.06 
 
 		 193 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0180  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  29.79 
 
 		 195 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.41 
 
 		 183 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  30 
 
 		 268 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  29.59 
 
 		 194 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>