More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1669 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1669  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
278 aa  543  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1163  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  57.04 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1095  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.9 
 
 
282 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2104  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.09 
 
 
282 aa  295  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1958  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.45 
 
 
287 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.86 
 
 
604 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0620  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  48.13 
 
 
274 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.363148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0606  phosphate ABC transporter, permease protein  47.76 
 
 
274 aa  248  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.32336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.24 
 
 
645 aa  239  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0140  phosphate ABC transporter, permease protein  45.62 
 
 
283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0067  phosphate ABC transporter, permease protein  47.78 
 
 
289 aa  235  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  47.43 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05139  molybdate ABC transporter permease protein  48.85 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  47.41 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  47.1 
 
 
284 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2590  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstA  46.55 
 
 
281 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00589787  normal  0.413693 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_148  phosphate ABC transporter, permease protein  45.26 
 
 
283 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.62 
 
 
283 aa  229  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  44.01 
 
 
649 aa  227  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4230  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.66 
 
 
283 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  46.74 
 
 
627 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48 
 
 
646 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1060  phosphate ABC transporter permease  42.64 
 
 
297 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0763  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.16 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.763641  normal  0.179278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2832  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.62 
 
 
294 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2888  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.54 
 
 
288 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107723 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1008  ABC-type phosphate transport system, permease component  38.71 
 
 
294 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1964  phosphate ABC transporter, permease protein  43.85 
 
 
292 aa  206  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21560  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.41 
 
 
284 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1603  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.96 
 
 
291 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0162233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0564  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.91 
 
 
306 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000405763  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.83 
 
 
270 aa  200  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1927  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.12 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0747671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.92 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0591  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.55 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0222  phosphate ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 
478 aa  195  5.000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.017754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0454  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.86 
 
 
294 aa  194  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0582  phosphate ABC transporter permease  40.96 
 
 
277 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0990  phosphate ABC transporter, permease protein PstA, putative  34.83 
 
 
295 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.164904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0549  ABC-type phosphate transport system, permease component  38.62 
 
 
296 aa  192  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00903188  hitchhiker  2.03288e-22 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4408  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.98 
 
 
280 aa  191  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0197285  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0703  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.46 
 
 
281 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.01 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1780  phosphate ABC transporter, permease protein  43.8 
 
 
307 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0750  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit  40.15 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000021979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1993  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.85 
 
 
295 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0349  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.29 
 
 
288 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000182732 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.33 
 
 
284 aa  183  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1879  ABC-type phosphate transport system, permease component  36.52 
 
 
297 aa  183  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.93 
 
 
289 aa  183  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.65 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1953  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.13 
 
 
294 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.22501  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0945  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.21 
 
 
449 aa  178  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.526436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4585  putative phosphate ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
306 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.206846 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.46 
 
 
293 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0019112  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.37 
 
 
290 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0154936  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0422  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.7 
 
 
295 aa  176  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2102  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.84 
 
 
284 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28120  phosphate ABC transporter membrane protein  37.11 
 
 
285 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1618  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.07 
 
 
448 aa  175  9e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1040  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.45 
 
 
448 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.06 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.158794  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.08 
 
 
596 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2418  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.92 
 
 
940 aa  172  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.420057  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0683  phosphate ABC transporter permease  37.91 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0627  phosphate ABC transporter, permease  37.91 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0627  phosphate ABC transporter, permease  37.91 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0846  putative phosphate ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0717  phosphate ABC transporter permease  37.91 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0772  putative phosphate ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000179508 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.25 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1477  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.25 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.508211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0752  putative phosphate ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 
306 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0786  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  37.91 
 
 
306 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1827  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.06 
 
 
297 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0633  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.99 
 
 
306 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.454449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4172  phosphate ABC transporter permease  39.55 
 
 
288 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4494  phosphate ABC transporter permease  39.55 
 
 
288 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4010  phosphate ABC transporter, permease  39.55 
 
 
288 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4020  phosphate ABC transporter, permease  39.55 
 
 
288 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1235  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.06 
 
 
448 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4123  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.45 
 
 
288 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4290  phosphate ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 
288 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559042 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1243  phosphate ABC transporter permease  46.08 
 
 
448 aa  169  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.352421  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0558  ABC-type phosphate transport system, permease component  33.68 
 
 
298 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2394  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.74 
 
 
304 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4386  phosphate ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 
288 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.446606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4350  phosphate ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0126  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.59 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4403  phosphate ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0850  phosphate ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 
288 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.69 
 
 
358 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0113  phosphate ABC transporter permease  32.31 
 
 
310 aa  165  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0981  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.24 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0889131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2297  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.26 
 
 
279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0177  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.53 
 
 
307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0605  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.82 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.8 
 
 
281 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.25 
 
 
283 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2333  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  39.15 
 
 
293 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>