22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1651 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1651  major facilitator transporter  100 
 
 		 422 aa  848    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0839039  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1837  fucose permease  47 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0765737  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0874  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.499239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  27.36 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 369 aa  50.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  25.57 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  22.75 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  27.52 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  24.27 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  25.63 
 
 		 390 aa  43.5  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  27.52 
 
 		 383 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.88 
 
 		 529 aa  43.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>