More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1609 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  32.36 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  31.27 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  30.18 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 276 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  28.62 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  25.89 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 289 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  23.66 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  26.07 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  21.38 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  27.72 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  27.96 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  20.7 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.13 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  24.04 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  24 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  38 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  23.97 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  22.83 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  24.11 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  23.05 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  22.6 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16760  predicted transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.498002 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  23.85 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  32.11 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  24.48 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  23.67 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3016  MerR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 120 aa  64.7  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  25.44 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  21.98 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  24.3 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  37.76 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  20.88 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 		 107 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1352  transcriptional regulator, MerR family  23.86 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0877122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  31.01 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  35.56 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  29.13 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2779  MerR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575166  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  28.32 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  21.31 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3050  transcriptional regulator, MerR family protein  26.32 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  28 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  21.79 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  20.58 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>