51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1601 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1601  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 446 aa  920    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00658825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.26 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000246195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1751  sensor histidine kinase VirS  26.32 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0035916  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1481  sensor histidine kinase VirS  25.88 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.53 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0430  ATP-binding region ATPase domain protein  26.45 
 
 		 313 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157774 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  28.18 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  27.01 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000737644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2346  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.88 
 
 		 609 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.600899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2424  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.08 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02250  histidine kinase  22.37 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.74 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000227922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2647  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.09 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.36 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2545  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.45 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.290644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0469  ATP-binding region ATPase domain protein  32.11 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1814  ATP-binding region ATPase domain protein  23.38 
 
 		 614 aa  60.1  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211625  normal  0.35963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2641  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  28.64 
 
 		 553 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.64 
 
 		 534 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.23 
 
 		 534 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  28.64 
 
 		 553 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  28.64 
 
 		 553 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  28.64 
 
 		 553 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.66 
 
 		 470 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000031179  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.57 
 
 		 456 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.46 
 
 		 325 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  26.43 
 
 		 552 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  26.43 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.43 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  26.43 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  26.43 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  26.43 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.23 
 
 		 545 aa  50.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.43 
 
 		 552 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0582  signal transduction protein  21.05 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.74 
 
 		 525 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.54 
 
 		 532 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24 
 
 		 241 aa  48.5  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.74 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.98 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.74 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.62 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0471  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.92 
 
 		 225 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0687563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3457  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0863  putative sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.24 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.81 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728956 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.1 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.51 
 
 		 538 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>