More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1596 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1596  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 852 aa  1742    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000479393  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2107  glycoside hydrolase family 3 protein  37.79 
 
 		 928 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136681  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19430  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.4 
 
 		 829 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17700  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.72 
 
 		 807 aa  337  5.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  39.07 
 
 		 708 aa  238  3e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  38.2 
 
 		 701 aa  235  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  38.15 
 
 		 721 aa  225  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  37.79 
 
 		 814 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  37.91 
 
 		 722 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  35.96 
 
 		 717 aa  215  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 		 714 aa  211  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.71 
 
 		 758 aa  204  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.71 
 
 		 749 aa  204  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  37.25 
 
 		 793 aa  200  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.25 
 
 		 748 aa  199  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  36.93 
 
 		 793 aa  199  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.85 
 
 		 755 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.96 
 
 		 790 aa  196  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  37.64 
 
 		 800 aa  196  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  37.45 
 
 		 757 aa  194  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 755 aa  193  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.11 
 
 		 741 aa  189  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.08 
 
 		 750 aa  188  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  39.46 
 
 		 750 aa  188  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.65 
 
 		 777 aa  187  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  39.22 
 
 		 740 aa  187  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  36.4 
 
 		 762 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.86 
 
 		 757 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.37 
 
 		 813 aa  186  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  39.92 
 
 		 823 aa  184  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  36.33 
 
 		 874 aa  184  7e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02280  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.03 
 
 		 1001 aa  184  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0284984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.47 
 
 		 751 aa  184  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  38.04 
 
 		 737 aa  182  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  39.47 
 
 		 749 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.3 
 
 		 809 aa  181  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  38.3 
 
 		 747 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  38.02 
 
 		 845 aa  181  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.22 
 
 		 814 aa  180  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.5 
 
 		 780 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  46.11 
 
 		 851 aa  174  5e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  39.53 
 
 		 914 aa  172  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  36.09 
 
 		 818 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.08 
 
 		 742 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  34.98 
 
 		 738 aa  171  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  35.86 
 
 		 831 aa  170  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  34.98 
 
 		 738 aa  170  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  37.65 
 
 		 760 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  38.46 
 
 		 915 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.04 
 
 		 820 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  36.96 
 
 		 836 aa  169  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  34.63 
 
 		 838 aa  164  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  45.27 
 
 		 852 aa  163  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  40.93 
 
 		 839 aa  164  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.72 
 
 		 757 aa  162  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.82 
 
 		 758 aa  161  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  35.6 
 
 		 850 aa  160  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2633  hypothetical protein  42.21 
 
 		 805 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  36.36 
 
 		 895 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  37.21 
 
 		 721 aa  159  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  43.98 
 
 		 829 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  35.41 
 
 		 884 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.25 
 
 		 737 aa  156  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  35.37 
 
 		 833 aa  156  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.52 
 
 		 734 aa  156  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.7 
 
 		 746 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37 
 
 		 711 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  42.19 
 
 		 843 aa  156  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  41.15 
 
 		 843 aa  155  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  35.57 
 
 		 913 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  34.63 
 
 		 897 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  39.53 
 
 		 738 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.06 
 
 		 497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  37.39 
 
 		 906 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  33.72 
 
 		 745 aa  149  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  31.36 
 
 		 887 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.44 
 
 		 820 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0472  Beta-glucosidase  37.32 
 
 		 985 aa  144  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.571206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  42.07 
 
 		 730 aa  144  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  37.69 
 
 		 866 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.23 
 
 		 839 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.54 
 
 		 874 aa  142  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  34.03 
 
 		 870 aa  141  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.34 
 
 		 813 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  33.89 
 
 		 857 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  32.81 
 
 		 816 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  36.24 
 
 		 832 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  38.17 
 
 		 772 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  34.7 
 
 		 691 aa  134  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  32.07 
 
 		 897 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  37.5 
 
 		 737 aa  130  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  36.96 
 
 		 716 aa  130  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  35.14 
 
 		 685 aa  130  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  33.04 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  37.07 
 
 		 931 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  33.04 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  33.04 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  35.45 
 
 		 779 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>