90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1576 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1575  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  75.89 
 
 
561 aa  897    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0287322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1576  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
559 aa  1136    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1574  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.43 
 
 
560 aa  595  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.266875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1573  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.79 
 
 
559 aa  597  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1571  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.82 
 
 
559 aa  586  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1572  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.71 
 
 
559 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2817  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.07 
 
 
538 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3538  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.19 
 
 
571 aa  350  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2070  subtilase family protein  31.45 
 
 
584 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.725606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2368  subtilase family protein  30.96 
 
 
584 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2888  serine protease A  31.24 
 
 
578 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2886  serine protease C  31.84 
 
 
582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2369  subtilase family protein  31.55 
 
 
536 aa  243  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2071  subtilisin like protease  30.56 
 
 
553 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0532  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.87 
 
 
582 aa  227  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0318765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2567  protease CspB  31.6 
 
 
564 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2887  protease CspB  31.29 
 
 
565 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1811  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 
618 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.81 
 
 
715 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53699  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.9 
 
 
578 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0383041  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
891 aa  73.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.06 
 
 
1124 aa  72  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5781  hypothetical protein  23.09 
 
 
748 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112335  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.09 
 
 
576 aa  60.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5651  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.46 
 
 
628 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  35.61 
 
 
644 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 
1783 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 
986 aa  57  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  40.43 
 
 
1618 aa  56.6  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  24.18 
 
 
917 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  24.18 
 
 
917 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  32.03 
 
 
697 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1792  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.26 
 
 
686 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0554398 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  34.44 
 
 
1351 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.29 
 
 
848 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
1501 aa  55.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.45 
 
 
1361 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  20.83 
 
 
883 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.67 
 
 
835 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000302047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1065  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.62 
 
 
442 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0023  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.15 
 
 
1008 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.421595  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0534  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.78 
 
 
698 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.709674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.65 
 
 
1797 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
999 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.04 
 
 
997 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  32.43 
 
 
1570 aa  50.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.13 
 
 
1106 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2279  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.23 
 
 
589 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.77 
 
 
398 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.08 
 
 
1016 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1569  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.27 
 
 
806 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.33 
 
 
860 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.15 
 
 
1253 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1626  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 
432 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0085  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
866 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.23 
 
 
1773 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.96 
 
 
1453 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1650  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 
557 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.920736  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.06 
 
 
1054 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.95 
 
 
1078 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4630  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 
1405 aa  47.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.46 
 
 
509 aa  47.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  31.78 
 
 
1170 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1604  hypothetical protein  34.38 
 
 
531 aa  47  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103561  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.07 
 
 
1092 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.25 
 
 
860 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  37.17 
 
 
1223 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4242  hypothetical protein  29.59 
 
 
903 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37715  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C42  lactocepin I  22.64 
 
 
1962 aa  47  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.1 
 
 
1110 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0927  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.68 
 
 
795 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2389  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.73 
 
 
533 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.377717  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  28.05 
 
 
1809 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.37 
 
 
1451 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0995  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.12 
 
 
398 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.15 
 
 
431 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
1060 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  31.36 
 
 
692 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.19 
 
 
349 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  26.28 
 
 
1285 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3544  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.92 
 
 
711 aa  44.3  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.15 
 
 
445 aa  44.3  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00404816  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40456  predicted protein  27.74 
 
 
834 aa  43.9  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0509  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.39 
 
 
412 aa  43.9  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.89 
 
 
641 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0754  alkaline serine protease  33 
 
 
567 aa  43.9  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  35.71 
 
 
307 aa  43.9  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.16 
 
 
1052 aa  43.5  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1767  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
773 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.38 
 
 
1029 aa  43.5  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>